Biomolekulinių sistemų modeliavimo grupė

Moksliniai tyrimai

Teorinis sudėtingų molekulinių sistemų struktūrinių, dinaminių, spektrinių bei termocheminių parametrų modeliavimas yra kasdienė mūsų grupės mokslinė veikla. Šiems parametrams modeliuoti pasitelkiame modernius kompiuterinius metodus - elektroninės struktūros skaičiavimus, molekulių dinamikos simuliacijas bei jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos (QM/MM) modelius. Šie metodai leidžia tiksliai prognozuoti įvairias didelių molekulinių sistemų, susidedančių iš tūkstančių ar dešimčių tūkstančių atomų, elektronines savybes. Dažnai naudojame integruotą modeliavimo schemą, kuri apjungia molekulių dinamikos simuliacijas bei QM/MM metodus, o tai įgalina atsižvelgti į molekulių dinamikos įtaką jų elektroninėms savybėms duotomis termodinaminėmis sąlygomis.

Pastaruoju metu itin aktyviai modeliuojame antrosios ir trečiosios kartos joninių skysčių struktūrą bei spektrinius branduolių magnetinio rezonanso parametrus siekdami išaiškinti šių modernių medžiagų bioveikimo molekulinius mechanizmus. Tiriame ne tik šiems skysčiams būdingo nanostruktūrizavimosi ypatumus, bet ir jų įtaką biomolekulių elgsenai ir savybėms. Tampriai bendradarbiaudami su kolegomis iš Lietuvos ir užsienio universitetų, taip pat modeliuojame metalo-organinių karkasų struktūrą ir EPR parametrus, vaistinių junginių termochemines savybes bei supramolekulinėse matricose inkapsuliuotų biomolekulių struktūrinius ypatumus ir branduolių magnetinio rezonanso parametrus.

Mokslinis bendradarbiavimas

Prof. F. Mocci (Kaljario universitetas, Italija)

Prof. Aa. Laaksonen (Stokholmo universitetas, Švedija)

Prof. A. Cedillo (UAM-Iztapalapa, Meksikas, Meksika)

Prof. M. Šimėnas (Vilniaus universitetas)

Dr. V. Klimavičius (Vilniaus universitetas)

Prof. E. Orentas (Vilniaus universitetas)

Moksliniai projektai

Lietuvos mokslo tarybos Mokslininkų grupių projektas “Bioaktyvių joninių skysčių struktūrinių ir BMR spektrinių parametrų modeliavimas”, nr. S-MIP-22-74, 2022-2025 m.

Studentams

Vilniaus universiteto studentai maloniai kviečiami prisijungti prie Biomolekulinių sistemų modeliavimo grupės ir atlikti savo mokslinės praktikos bei baigiamuosius darbus. Spręsite biofizikiniu ir biocheminiu požiūriu aktualias problemas, naudodami modernius molekulių modeliavimo įrankius bei pasitelkdami Vilniaus universiteto superkompiuterį. Grupės studentai labai dažnai pristato savo mokslinės veiklos rezultatus studentiškose ir nacionalinėse mokslinėse konferencijose; taip pat atlieka Lietuvos mokslo tarybos finansuojamus mokslinius projektus studijų ar vasaros atostogų metu.