Rašto darbai - Fizikos fakultetas

Baigiamųjų darbų svarstymai Cheminės fizikos institute 2023/2024 m. m. pavasarį

Institutas,

atsakingas asmuo

Baigiamųjų darbų bakalaurams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Baigiamųjų darbų magistrantams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Cheminės fizikos institutas

Julija Gorbaniova

1 komisija (V. Šablinskas – Molekulių spektroskopijos grupė)

Gegužės 22 d. (trečiadienis), 9-12 val., Saulėtekio al. 3 (NFTMC), B336 seminarų kambarys.

Darbus pdf formatu atsiųsti iki gegužės 21 d., 9 val. adresu .

2 komisija (D. Abramavičius -Molekulių teorijos ir modeliavimo grupė)

Gegužės 24 d. (penktadienis), 9-12 val., Saulėtekio al. 9, III rūmai (Fizikos fakultetas), 311 aud.

Darbus pdf formatu atsiųsti iki gegužės 22 d., 10 val.

adresu

3 komisija (K. Genevičius – Kietojo kūno elektronikos grupė)

Gegužės 23 d. (ketvirtadienis), 10-16 val., Saulėtekio al. 3 (NFTMC), B336 seminarų kambarys.

Darbus pdf formatu atsiųsti iki gegužės 21 d., 10 val.

adresu

1 komisija (V. Šablinskas – Molekulių spektroskopijos grupė)

Gegužės 22 d. (trečiadienis), 12-13 val., Saulėtekio al. 3 (NFTMC), B336 seminarų kambarys.

Darbus pdf formatu atsiųsti iki gegužės 21 d., 9 val. adresu .

2 komisija (D. Abramavičius -Molekulių teorijos ir modeliavimo grupė)

Gegužės 24 d. (penktadienis), 13-15 val., Saulėtekio al. 9, III rūmai (Fizikos fakultetas), 311 aud.

Darbus pdf formatu atsiųsti iki gegužės 22 d., 10 val.

adresu

SVARBU! Jeigu darbo vadovas negalės asmeniškai dalyvauti gynime, jo atsiliepimas turi būti pateiktas komisijai raštu.

Profesinės praktikos, Baigiamojo darbo (ŠT), Mokslo tiriamojo darbo 2023/2024 m. m. rudens semestro gynimai institutuose

Institutas,

atsakingas asmuo

Profesinės praktikos bakalaurams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Mokslo tiriamojo darbo magistrantams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Cheminės fizikos institutas

(Julija Gorbaniova,

tel. (8 5) 223 4560,

el.p. )

2023-12-19, 10:00-11:30 val. NFTMC B336 (Prof. praktika Šviesos technologijų studentams)

Darbus siųsti iki gruodžio 18 d., 12 val.

2024-01-10, 13:00-14:30 val. NFTMC B336 (BD Šviesos technologijų studentams)

Darbus siųsti iki sausio 6 d., 15 val.

I. 2024-01-23, 10:00-15:00 val. NFTMC B336 (Prof. praktika ne Šviesos technologijų studentams)

Molekulių spektroskopijos grupė

(prof. V. Šablinskas)

Darbus siųsti iki sausio 22 d., 10 val.

II. 2024-01-25, 9:00-11:00 val. NFTMC B336 (Prof. Praktika ne Šviesos technologijų studentams)

Molekulių teorijos ir modeliavimo grupė

(prof. D. Abramavičius)

Darbus siųsti iki sausio 23 d. vakaro.

III. 2024-01-24, 13:00-16:00 val. NFTMC B336 (Prof. praktika ne Šviesos technologijų studentams)

Kietojo kūno elektronikos grupė

(dr. K. Genevičius)

Darbus siųsti iki sausio 22 d., 12 val.

I. 2024-01-23, 10:00-15:00 val. NFTMC B336

Molekulių spektroskopijos grupė (prof. V.Šablinskas)

Darbus siųsti iki sausio 22 d., 10 val.

II. 2024-01-25, 13:00-16:00 val. NFTMC B336 Molekulių teorijos ir modeliavimo grupė

(prof. D. Abramavičius)

Darbus siųsti iki sausio 23 d. vakaro.

SVARBU! Jeigu darbo vadovas negalės asmeniškai dalyvauti gynime, jo atsiliepimas turi būti pateiktas komisijai raštu.

Mokslo tiriamųjų darbų perlaikymas 2023 m. rugsėjį

Rašto darbų temos 2023/2024 m.m. rudens semestrui

Profesinė praktika (IV k. Fizika, Taikomoji fizika, Telekomunikacijų fizika ir elektronika, Kompiuterinė fizika ir modeliavimas, Moderniųjų technologijų fizika ir vadyba)

Eil. Nr.	Vadovas (vadovo el. p., darbo tel. nr.)	Temos pavadinimas (lietuvių ir anglų kalbomis)	Trumpas temos aprašymas (lietuvių kalba)	Tema laisva/užimta
1.	dr. Rokas Dobužinskas (, 8 662 38767)	Biologinių sistemų tyrimas veikiant jonizuojančia spinduliuote Ivestigation of Biological Systems Exposed to Ionising Radiation	Gyvieji organizmai veikiami natūralaus radiacinio fono, kuris nuolat daro pažeidimus biologinėse sistemose. Ląstelės turi apsisaugojimo mechanizmus, kurie leidžia atstatyti sukurtus pokyčius. Mokslo šaka, tyrinėjanti jonizuojančios spinduliuotės veikimą gyvybei yra ganėtinai sena, tačiau tikslūs biologiniai ir fizikiniai mechanizmai vis dar nėra iki galo ištirti. Šiuo darbu bandysime taikyti naujus elektrinius metodus ir gilintis į fizikinius mechanizmus, kurie galėtų paaiškinti biologinių sistemų veikimą	Laisva
2.	dr. Rokas Dobužinskas (, 8 662 38767)	Riebalų rugščių kristalitų gamyba ir jų fizikinių savybių tyrimas Production of fatty acid crystallites and investigation of their physical properties	Gyvoje gamtoje išgaunamos riebalų rūgštys, kurios geba sudaryti kietas kristalines formas, šiuo metu plačiausiai pritaikomos maisto pramonėje – šokolado gamyboje. Šokolado gaminiai yra išgaunami specialiomis temperavimo technologijomis išgaunant stabiliausią, kuo aukštesnėje temperatūroje besilydančią ir mechaniškai kiečiausią kristalinę formą. Šiame darbe bus gaminami riebalų rūgščių kristalitai ir tiriamos jų fizikinės savybės. Pagaminti kristalai bus analizuojami rentgeno spindulių difrakcija (naujuoju Rigaku SmartLab prietaisu)	Laisva
3.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	NASICON tipo kompozitinių medžiagų, skirtų baterijų taikymams, kietojo kūno BMR spektroskopija Solid state NMR of NASICON based materials for sodium batteries	Tirsime kietojo kūno BMR metodais medžiagas, kurios yra skirtos natrio baterijoms. Tokios baterijos gali būti panaudotos elektros tinklo stabilizavimo poreikiams tenkinti	Laisva
4.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	Kalcio fosfatų, skirtų kaulų audinių inžinerijai, kietojo kūno BMR spektroskopija Solid state NMR of calcium phosphates for bone tissue engineering	Tirsime kietojo kūno BMR metodais kalcio fosfatų pagrindu pagamintas medžiagas. Jos yra skirtos kaulų inžinerijai, nes primena kietuosius kaulinius audinius	Laisva
5.	Mindaugas Viliūnas tel. 868728948	Bipolinės išėjimo įtampos 4 kvadrantų keitiklio tyrimas Investigation of bipolar output four-quadrant converter	4 kvadrantų keitiklis, priklausomai nuo jame naudojamų raktų valdymo, gali dirbti kaip teigiamos ar neigiamos įtampos srovę tiekiantis ar paimantis(grąžinantis į prijungtą maitinimo šaltinį) prietaisas. Darbo metu reikės ištirti šio, LT8714 valdiklio pagrindu padaryto, naujoviškos topologijos keitiklio charakteristikas ir jų priklausomybes nuo grandinės parametrų	Laisva
6.	Mindaugas Viliūnas tel. 868728948	Aktyvinio elektromagnetinės spinduliuotės filtro taikymo tyrimas Investigation of active EMI filter application	Kovojant su impulsinių grandinių skleidžiamais elektromagnetiniais trikdžiais iki šiol buvo naudojamos pasyvios technologijos- LC filtrai ir ekranai. Šiame darbe siūloma patyrinėti neseniai pasirodžiusią aktyvią trikdžių slopinimo sistemą TPSF12C1 pagrindu, slopinančią trikdžius priešfazinio signalo injekcijos būdu	Laisva
7.	Gytis Sliaužys (, 8 5 223 4553)	Krūvininkų pernašos savybių tyrimas organiniuose lauko tranzistoriuose Investigation of charge carriers transport properties in organic field-effect transistors	Šio darbo tikslas: pasigaminti organinius lauko tranzistorius naudojant skirtingus organinius puslaidininkius; skirtingomis metodikomis ištirti, šių puslaidininkių, krūvio pernašos savybes organiniuose lauko tranzistoriuose; iš gautų rezultatų nustatyti naudotų organinių puslaidininkių tinkamumą organiniams lauko tranzistoriams	Laisva
8.	Vadovas J. Franukevičius, Konsultantas M. Mačernis. ,	BMR sukinių tarpusavio sąveikos J skaičiavimų metodų parinkimo tyrimas potencialiems kvantinio kompiuteriui skirtoms molekulėms Investigation of NMR spin coupling J computational methods of molecules required .for quantum computing	Molekulėse esančių branduolių sukinių tarpusavio sąveikos J skaičiavimų metodikos tobulinimas atsižvelgiant į literatūroje esančius eksperimentinius duomenis. Tyrimo tikslas: rasti tinkamiausią tankio funkcionalo teorijos metodą, kurio rezultatai būtų su kuo mažesne paklaida lyginant su žinomais eksperimentiniais duomenimis. Skaičiavimai bus atliekamai su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
9.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Aleno karotinoidų krūvio pernašos būsenų modeliavimas Charge transfer state modeling for allene carotenoids	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Aleno karotinoidai pasižymi papildoma krūvio pernašos būsena, kuri vizualiai priklauso nuo molekulės cheminė struktūros. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes. Reikės modeliuoti struktūras, atlikti kvantinę molekulių dinamiką. Atlikti MD skaičiavimus su naujausiu AMBER paketu ir ab initio skaičiavimus su Gaussian 16 ir NwChem ir kitais įsisavintais paketais. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
10.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Įvairių baltymų modeliavimas su karotinoidais panaudojant GROMACS paketą Modeling of Various Carotenoids with Protein using GROMACS package	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Karotinoidų savybės priklauso nuo baltyminės aplinkos, kuri yra kintanti laike, todėl reikalingas detalus sistemos aprašymas norint suprasti spektrines savybes, o tam reikalingi paketų našumo analizės tyrimai, tokių kaip GROMACS. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant GROMACS ir Gaussian 16 paketus. Reikės įdiegti GROMACS paketą, atlikti našumo tyrimus. Atlikti ab initio skaičiavimus karotinoidams esantiems baltyminėje aplinkoje su Gaussian 16 ir GROMACS paketais. Reiks atlikit superkompiuterio našumo analizę ir paruošti GROMACS naudojimo instrukcijas. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
11.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų duomenų bazė ir informacinė sistema The Database and Information System for the results of the Quantum Chemical calculations	Superkompiuterių kvantinės chemijos panaudojimo efektyvumui naudojamos sistemos kaip WebMO, kurios skirtos uždavinių paruošimui ir vykdymui. Tuo tarpu labai svarbu tinkamai saugoti jau atliktus skaičiavimus. Tam, kad vartotojas galėtų lengviau pasiekti ir redaguoti tuos duomenis, yra naudojamos informacinės sistemos, kurios palengvina darbą su duomenų bazėmis –pateikiama paprasta aplinka duomenims įkelti, tvarkyti, trinti ir atvaizduoti. Skirtingi kvantinės chemijos programų paketai turi didelį kiekį skirtingų skaičiavimo algoritmų, iš kurių vieni sutampa, o kiti skiriasi. Darbo tikslas automatizuoti ir pritaikyta kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų leidimui, saugojimui, jų automatizuotai analizei ir turėtų informacinę sistemą, kurioje daugelis vartotojų (šiuo metu pritaikyta vienam vartotojui) gali lengvai pasiekti bei tvarkyti kvantinių skaičiavimų duomenis. Įdiegti vieną pasirinktą kvantinės chemijos paketą ir atlikti našumo testus. Skaičiavimai bus atliekamai superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis.	Laisva
12.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Įvairių baltymų modeliavimas su karotinoidais panaudojant pasirinktą kantinės chemijos paketą Modeling of Various Carotenoids with Protein using chosen quantum chemistry package	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Karotinoidų savybės priklauso nuo baltyminės aplinkos, kuri yra kintanti laike, todėl reikalingas detalus sistemos aprašymas norint suprasti spektrines savybes, o tam reikalingi paketų našumo analizės tyrimai, tokių kaip NwChem, Orca, Quantum ESPRESSO ir kt.. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant pasirinktą paketą. Reikės įdiegti paketą, įgyti kompiliavimo žinių su C++/FORTRAN/Java/Python ir atlikti našumo tyrimus. Atlikti ab initio skaičiavimus karotinoidams esantiems baltyminėje aplinkoje su pasiriktu paketais. Reiks atlikit superkompiuterio našumo analizę ir paruošti paketo naudojimo instrukcijas. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
13.	Doc. dr. Kęstutis Aidas, , 8 5 223 4593	Makromolekulinėse matricose inskapsuliuotų molekulių struktūros ir BMR spektrų modeliavimas Modelling structural and NMR properties of molecules bound to supramolecular cavitands	Supramolekulinių darinių tyrimai šiuo metu yra itin aktyvi mokslinės veiklos. Įdomu tai, kad molekulėms prisijungus vadinamųjų supramolekulinių kavitandų ertmėse, šių molekulių savybės gali pasikeisti drastiškai – gali būti stabilizuojamos įprastai energetiškai nepalankios konformacijos, inicijuojamos egzotiškos cheminės reakcijos, ar padidinamas šiaip vandenyje netirpių molekulių tirpumas. Šios molekulinės sistemos labai perspektyvios, nes gali būti panaudojamos, pavyzdžiui, kaip vaistinių junginių nešikliai arba kaip selektyvūs biomolekulių jutikliai. Norint plėsti supramolekulinių kavitandų taikymo galimybes, būtina detaliai suprasti molekulės-kavitando komplekso struktūrą bei kavitanduose inkapsuliuotų molekulių elgseną molekuliniame lygmenyje. Šiame darbe bus modeliuojami molekulių, inkapsuliuotų supramolekuliniuose kavitanduose, struktūra ir branduolių magnetinio rezonanso spektrai taikant modernius molekulinių sistemų modeliavimo metodus – klasikines molekulinės dinamikos simuliacijas ir jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos modelius. Visi modeliavimo darbai bus atliekami VU aukšto našumo skaičiavimo centro „HPC Saulėtekis“ superkompiuteriu	Laisva
14.	Doc. dr. Kęstutis Aidas, , 8 5 223 4593	Joninių skysčių mišiniai su tradiciniais tirpikliais: struktūros ir BMR spektrų modeliavimas Modelling structural and NMR properties of mixtures between ionic liquids and traditional solvents	Joniniai skysčiai yra modernios, itin aktyviai tyrinėjamos medžiagos, sudarytos vien tik iš organinių molekulinių katijonų ir organinių arba neorganinių anijonų. Kadangi katijonų molekulinė struktūra pasižymi tam tikra asimetrija, dažnai JS, – kitaip nei įprastinės druskos, – išlieka skysti kambario ar netgi dar žemesnėje temperatūroje. Dėl savo išskirtinės sudėties šie skysčiai pasižymi unikaliomis savybėmis, kurios atveria duris įvairialypiams jų taikymams cheminėje inžinerijoje, gyvybės moksluose ir nanotechnologijose. Siekiant suprasti ir kontroliuoti joninių skysčių fiziko-chemines savybes, būtina turėti detalią informaciją molekuliniame lygmenyje apie šių sistemų tarpmolekulinę struktūrą ir dinamiką. Šiame darbe bus modeliuojami imidazolio katijono šeimos joninių skysčių ir dichlormetano mišinių struktūra ir branduolių magnetinio rezonanso spektrai taikant modernius molekulinių sistemų modeliavimo metodus – klasikines molekulinės dinamikos simuliacijas ir jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos modelius. Visi modeliavimo darbai bus atliekami VU aukšto našumo skaičiavimo centro „HPC Saulėtekis“ superkompiuteriu	Laisva
15.	Robertas Maldžius, , Saulėtekio al. 3, A330 +370 (5)223 4556	Spektrinis fotojautris ir fotogeneracijos kvantinis našumas skersaryšintuose organiniuose sluoksniuose fotovoltaikos prietaisams Spectral photosensitivity and photogeneration quantum efficiency in cross-linked organic layers for photovoltaic devices	Saulės elementams (fotovoltiniams prietaisams), sintetinamos cheminės medžiagos tinkamumą įvertiname tada, kai nustatoma visa eilė fizikinių parametrų. Vieni iš tokių yra spektrinis fotojautris ir fotogeneracijos kvantinio našumo spektrinis pasiskirstymas. Darbo metu tyrinėjame kaip medžiagos skersaryšinimo cheminės reakcijos įtakoja minėtų spektrinių charakteristikų pakitimus, lemiančius būsimo fortovoltinio prietaiso našumo augimą	laisva
16.	Robertas Maldžius, , Saulėtekio al. 9, III, 622 +370 (5)236 6052	Krūvininkų dinamikos tyrimai dielektriniuose fotovoltinių prietaisų sluoksniuose dozuoto įelektrinimo-išelektrinimo metodu Studies of the dynamics of charge carriers in the dielectric layers of photovoltaic devices using the dosed charge-discharge method	Metodika leidžia nustatyti, ar susintetinta cheminė medžiaga gali būti tinkama saulės elemento (fotovoltinio prietaiso) gamyboje. Medžiagą charakterizuojame visa eile parametrų, tokių kaip ribinis įelektrėjimo potencialas, paviršinio krūvio injekcijos srovių dydis, efektinė dielektrinė skvarba bei dielektrinis storis ir kt. Darbo metu deriname prietaisus bei išmatuojame naujai sintetintų cheminių medžiagų voltkulonines bei voltfaradines charakteristikas	laisva
17.	Robertas Maldžius, , Saulėtekio al. 9, III, 622 +370 (5)236 6052	Drėgmės difuzija dielektrinėse struktūrose, matuojant paviršiaus elektrinį laidumą Moisture diffusion in the dielectric structures by measuring the electrical conductivity of a surface	Pasaulyje kuriamos technologijos, kuriose popieriaus pakuotėje nenaudojamas plastikas. Tuo pat metu tokia danga turi apsaugoti nuo drėgmės poveikio. Vandens garų difuzijos nustatymo metodas, pagrįstas paviršinio elektrinio laidumo kinetikos matavimu, įgalina popieriaus pakuotės technologinio gamybos proceso metu sparčiai nustatyti dangos tinkamumą, kokybę ir kitus parametrus. Darbe bus tyrinėjami metodikos teoriniai aspektai bei atliekami daugiasluoksnių popierinių dangų atsparumo drėgmei tyrimai	laisva
18.	Kristijonas Genevičius tel.: 85 233 4553	Foto sužadintų krūvininkų ekstrakcija dariniuose metalas-dielektrikas – puslaidininkis Extraction of photogenerated charge carriers in metal-dielectric-semiconductor structures	Puslaidininkyje fotogeneruoti krūvininkai elektriniu lauku bus pritraukiami prie izoliatoriaus ir po to ištraukiami tiesiškai kylančios įtampos impulsu. Planuojama tirti ambipolinių organinių puslaidininkių ar tūrinių heterosandūrų plonus sluoksnius. Darinių gamyba ir eksperimentas	Laisva
19.	Darius Abramavičius, , Saulėtekio al. 3, A312, Tel. (8 5) 223 4544	Eksitonų dinamikos ir disociacijos modeliavimas organiniuose saulės elementuose Modeling of excitation dynamics and charge separation in organic solar cells	Organiniai saulės elementai yra netvarkios medžiagos sudarytos iš donorinių ir akceptorinių molekulinių chromoforų. Naudojant fenomenologinį stipraus ryšio modelį bus modeliuojama sužadinimo kvantinė dinamika ir disociacija	laisva
20.	Nerijus Nekrašas,	Skylių pernašos tyrimai organiniuose binarinės sandaros sluoksniuose Investigation of hole transport in organic binary-blend layers	Pagrindiniai organinių elektronikos prietaisų trūkumai yra mažas krūvininkų judris juose (mažesnė greitaveika) bei menkas atsparumas aplinkos poveikiui. Mažų molekulių organiniuose junginiuose pasiekiami didesni krūvininkų judriai, bet kol kas neįmanoma efektyviai valdyti sluoksnio morfologijos. Kadangi polimerinių sluoksnių struktūra yra žymiai geriau kontroliuojama, tai mažų molekulių junginių komponavimas su polimerine matrica laikomas perspektyvia kryptimi. Pagrindinis šio darbo tikslas yra atskleisti naujai susintetintų mažamolekulinių organinių puslaidininkių panaudojimo perspektyvas, kombinuojant šias medžiagas su krūvį pernešančiais polimerais	Laisva
21.	Justinas Čeponkus/ +37052234595	Vandens sąveikos su organinėmis molekulėmis tyrimas virpesinės spektroskopijos metodais Study of water interaction with organic molecules using vibrational spectroscopy	Tyrimo tikslas tirti vandens sąveikos ypatybes su konjuguotomis pi elektronų sistemomis pvz. Benzenas. Tam bus taikomi keli skirtingi virpesinės spektrometrijos metodai. Studentas išmoks dirbti su dujiniais ir skystais bandiniai, susipažins su kriogeninės spektrometrijos technika	Laisva
22.	dr. Stepas Toliautas (85) 223 4661	Molekulių struktūros nustatymo skaičiavimų modeliais tikslumo ribos Accuracy limits of computationally modeled molecular structure	LT: Molekulės struktūros nustatymas yra daugiamačio energijos optimizavimo uždavinys, ir skirtingos parametrų (pvz., ryšių ilgių) vertės neretai atitinka praktiškai vienodas energijos reikšmes. Darbo metu bus tiriama, kokio parametrų tikslumo verta tikėtis optimizuojant struktūros parametrus populiariais kvantinės chemijos paketais Numerical estimation of molecular structure is equal to multidimensional optimization problem w. r. t. energy, and differing parameters (e. g., bond lengths) may result in the same energy value. The goal of the study is to assess practical accuracy of the structural parameters obtained by commonly-used quantum chemistry packages	laisva
23.	dr. Stepas Toliautas (85) 223 4661	Hidrodinamikos uždavinių nestabilių sprendinių vizualizavimas realiu laiku Real-time visualization of unstable solutions in hydrodynamic simulations	Mikroskopinės skysčių savybės lemia juose stebimus netiesinės dinamikos reiškinius, pvz., savitvarką ir chaotiškumą, kuriuos galima užrašyti per analizinius sprendinius, bet ne taip paprasta modeliuoti smulkiu masteliu. Tyrimo metu dinamikos uždaviniai bus bandomi spręsti „realiu laiku“, t. y. 1 s sprendinio apskaičiuojant / atvaizduojant per 1 s arba sparčiau Microscopic properties of fluids give rise to non-linear dynamics, such as self-organization and chaotic behavior. While such effects have analytical solutions, small-scale modeling of fluids is a non-trivial computational task. The goal of the study is to achieve “real-time” dynamics simulation, where 1 s of the solution is itself computed / presented in 1 s or less	laisva
24.	Feliksas Kuliešius,	Blokų grandinių taikymo daiktų internete modeliavimas Modeling of the Application of Blockchains in the IoT	Daiktų interneto (DI) tinklų saugos užtikrinimui vis dažniau taikomos blokų grandinių technologijos, kaip paskirstytųjų sistemų atvejis. Blokų grandinių taikymas DI dar nėra pakankamai ištyrinėtas. Tyrimai realiose sistemose būtų per daug brangūs ir sudėtingi, todėl būtinos kompiuterinės simuliacijos. Šio darbo tikslas yra sukurti kompiuterinę blokų grandinių tinklo modeliavimo sistemą, kuri padėtų įvertinti blokų grandinių taikymo galimybes dideliuose DI įrenginių tinkluose	laisva
25.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	Bioaktyviųjų joninių skysčių BMR spektroskopija NMR spectroscopy of bioactive ionic liquids	Aukštosios skyros metodais tirsime bioaktyviuosius joninius skysčius	Užimta
26.	Darius Abramavičius, , Saulėtekio al. 3, A312, Tel. (8 5) 223 4544	Elektron-fononiniai procesai kietame kūne Coupled electron-phonon processes in solid state	Elektron-fononinės sklaidos procesai apsprendžia elektronų ir skylių termalizaciją ir rekombinaciją. Naudojant stipraus ryšio modelį bus skaičiuojamos elektroninės ir fononinės charakteristikos puslaidininkiuose	Benas Anufrijevas
27.	Darius Abramavičius, , Saulėtekio al. 3, A312, Tel. (8 5) 223 4544	Elektron-fononiniai procesai makromolekuliniuose chromoforuose Coupled electron-phonon processes in macromolecular chromophores	Optiškai sužadintos molekulės dalyvauja šviesos konversijos procesuose organinėje elektronikoje. Darbe bus modeliuojami sužadinimo dinamikos ir rekombinacijos procesai	Rugilė Žalkauskaitė
28.	Nerijus Nekrašas,	Naujų monomolekulinių sluoksnių įtaka organinių lauko tranzistorių charakteristikoms Influence of new monomolecular layers on OFET characteristics	Bendradarbiaudami su chemikais nuolat gauname naujai susintetintų organinių medžiagų, tame tarpe skirtų labai ploniems, monomolekuliniams sluoksniams formuoti. Tokie sluoksniai gali būti naudojami kaip papildomi OFET dielektrikams padengti. Atliekant šį kursinį darbą reikėtų išmokti dirbti technologinėje laboratorijoje, patiems pasigaminti OFET ir su, ir be papildomo monomolekulinio sluoksnio bei ištirti jų charakteristikas.	Užimta
29.	Nerijus Nekrašas,	Krūvininkų pernašos tyrimai skersaryšinamose organinėse medžiagose Investigation of charge carriers transport in crosslinkable organic material	Gaminant daugiasluoksnius organinės elektronikos prietaisus iš tirpalų, iškyla problemos dėl apatinių sluoksnių tirpumo liejant viršutinius sluoksnius. Vienas iš sprendimo būdų yra specialiai tam sukurtų sluoksnių skersaryšinimas temperatūros ar cheminio poveikio pagalba, kurio metu medžiagoje susidaro papildomos cheminės jungtys tarp gretimų molekulių ir ji pasidaro nebetirpi. Žinoma, tokiuose sluoksniuose pasikeičia ir krūvio pernaša, todėl reikalingi papildomi tyrimai siekiant jas pritaikyti prietaisuose. Atliekant šį kursinį darbą reikėtų ir išmokti dirbti technologinėje laboratorijoje liejant sluoksnius, ir įsisavinti krūvio pernašos tyrimų aparatūrą	Užimta
30.	Justinas Čeponkus +37052234595	Sočiųjų karboksirūgščių struktūros ir tarpusavio sąveikos tyrimas Matricinės izoliacijos virpesinės spektrometrijos metodais Study of saturated monocarboxylic acids structure and association by the means of matrix isolation vibrational spectroscopy	Tyrimo tikslas taikant virpesinės spektrometrijos ir kvantinės chemijos metodus tirti karboksirūgščių (propano, butano, pentano) struktūrą, galimas konformacijas, bei nustatyti tarpusavio sąveikos energijas, susiformavusių kompleksų geometrinius parametrus	Užimta Redas Kazlauskas (Fizika)
31.	Justinas Čeponkus +37052234595	Spektrinių metodų taikymas mikroplastiko identifikavimui Application of spectroscopic methods for the identification of micro-plastics	Šiuolaikinė visuomenė susiduria su įvairiomis plastiko užterštumo formomis. Pastaruoju metu suprasta, kad greit suyrantis plastikas gamtoje vis tiek išlieka mikrodalelių formoje ir pavojingas gamtai ir žmogaus sveikatai. Spektriniai metodai galėtų būti taikomi užterštumo mikroplastiku tyrimams tačiau reikalingi išankstiniai tyrimai ir metodikos sukūrimas, kuris galėtų patvirtinti spektrinių metodų pritaikomumą. Studento darbo esmė atlikti mikroplastikų tyrimą skirtingais spektriniais metodais ir surasti optimalias sąlygas mikroplastiko identifikavimui gamtiniuose bandiniuose	Užimta Vita Remeikaitė ATFV
32.	Justinas Čeponkus/ +37052234595	Skirtingų mikroorganizmų identifikavimas virpesinės spektrometrijos metodais Identification of microorganisms using vibrational spectroscopy methods	Tyrimo tikslas taikant Ramano ir Infraraudonosios sugerties spektrinius metodus, identifikuoti skirtingus mikroorganizmus. Patikrinti galimybe, mikroorganizmus aptikti ant žmogaus odos	Tautvydas Taraškevičius
33.	Justinas Čeponkus/ +37052234595	Virpesinės spektrometrijos ir matricinės izoliacijos metodo taikymas molekulių struktūrinėje konformacinėje analizėje Application of matrix isolation vibrational spectroscopy in structural and conformational analysis of the molecules	Tyrimo tikslas taikant žemos temperatūros matricinės izoliacijos spektroskopijos ir kvantinės chemijos skaičiavimų metodus tirti molekulių turinčių kelias skirtingas konformacijas struktūras, nustatyti šių struktūrų pasikarstymą, bandinyje, energinius barjerus tarp jų	Klaudija Pukalskaitė ATFV

Profesinė praktika (IV k. Šviesos technologijos)

Eil. Nr.	Vadovas (vadovo el. p., darbo tel. nr.)	Temos pavadinimas (lietuvių ir anglų kalbomis)	Trumpas temos aprašymas (lietuvių kalba)	Tema laisva/užimta
1.	dr. Rokas Dobužinskas (, 8 662 38767)	Biologinių sistemų tyrimas veikiant jonizuojančia spinduliuote Ivestigation of Biological Systems Exposed to Ionising Radiation	Gyvieji organizmai veikiami natūralaus radiacinio fono, kuris nuolat daro pažeidimus biologinėse sistemose. Ląstelės turi apsisaugojimo mechanizmus, kurie leidžia atstatyti sukurtus pokyčius. Mokslo šaka, tyrinėjanti jonizuojančios spinduliuotės veikimą gyvybei yra ganėtinai sena, tačiau tikslūs biologiniai ir fizikiniai mechanizmai vis dar nėra iki galo ištirti. Šiuo darbu bandysime taikyti naujus elektrinius metodus ir gilintis į fizikinius mechanizmus, kurie galėtų paaiškinti biologinių sistemų veikimą	Laisva
2.	dr. Rokas Dobužinskas (, 8 662 38767)	Riebalų rugščių kristalitų gamyba ir jų fizikinių savybių tyrimas Production of fatty acid crystallites and investigation of their physical properties	Gyvoje gamtoje išgaunamos riebalų rūgštys, kurios geba sudaryti kietas kristalines formas, šiuo metu plačiausiai pritaikomos maisto pramonėje – šokolado gamyboje. Šokolado gaminiai yra išgaunami specialiomis temperavimo technologijomis išgaunant stabiliausią, kuo aukštesnėje temperatūroje besilydančią ir mechaniškai kiečiausią kristalinę formą. Šiame darbe bus gaminami riebalų rūgščių kristalitai ir tiriamos jų fizikinės savybės. Pagaminti kristalai bus analizuojami rentgeno spindulių difrakcija (naujuoju Rigaku SmartLab prietaisu)	Laisva
3.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	NASICON tipo kompozitinių medžiagų, skirtų baterijų taikymams, kietojo kūno BMR spektroskopija Solid state NMR of NASICON based materials for sodium batteries	Tirsime kietojo kūno BMR metodais medžiagas, kurios yra skirtos natrio baterijoms. Tokios baterijos gali būti panaudotos elektros tinklo stabilizavimo poreikiams tenkinti.	Laisva
4.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	Kalcio fosfatų, skirtų kaulų audinių inžinerijai, kietojo kūno BMR spektroskopija Solid state NMR of calcium phosphates for bone tissue engineering	Tirsime kietojo kūno BMR metodais kalcio fosfatų pagrindu pagamintas medžiagas. Jos yra skirtos kaulų inžinerijai, nes primena kietuosius kaulinius audinius	Laisva
5.	Gytis Sliaužys (, 8 5 223 4553)	Krūvininkų pernašos savybių tyrimas organiniuose lauko tranzistoriuose Investigation of charge carriers transport properties in organic field-effect transistors	Šio darbo tikslas: pasigaminti organinius lauko tranzistorius naudojant skirtingus organinius puslaidininkius; skirtingomis metodikomis ištirti, šių puslaidininkių, krūvio pernašos savybes organiniuose lauko tranzistoriuose; iš gautų rezultatų nustatyti naudotų organinių puslaidininkių tinkamumą organiniams lauko tranzistoriams	Laisva
6.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Aleno karotinoidų krūvio pernašos būsenų modeliavimas Charge transfer state modeling for allene carotenoids	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Aleno karotinoidai pasižymi papildoma krūvio pernašos būsena, kuri vizualiai priklauso nuo molekulės cheminė struktūros. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes. Reikės modeliuoti struktūras, atlikti kvantinę molekulių dinamiką. Atlikti MD skaičiavimus su naujausiu AMBER paketu ir ab initio skaičiavimus su Gaussian 16 ir NwChem ir kitais įsisavintais paketais. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
7.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Įvairių baltymų modeliavimas su karotinoidais panaudojant GROMACS paketą Modeling of Various Carotenoids with Protein using GROMACS package	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Karotinoidų savybės priklauso nuo baltyminės aplinkos, kuri yra kintanti laike, todėl reikalingas detalus sistemos aprašymas norint suprasti spektrines savybes, o tam reikalingi paketų našumo analizės tyrimai, tokių kaip GROMACS. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant GROMACS ir Gaussian 16 paketus. Reikės įdiegti GROMACS paketą, atlikti našumo tyrimus. Atlikti ab initio skaičiavimus karotinoidams esantiems baltyminėje aplinkoje su Gaussian 16 ir GROMACS paketais. Reiks atlikit superkompiuterio našumo analizę ir paruošti GROMACS naudojimo instrukcijas. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
8.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų duomenų bazė ir informacinė sistema The Database and Information System for the results of the Quantum Chemical calculations	Superkompiuterių kvantinės chemijos panaudojimo efektyvumui naudojamos sistemos kaip WebMO, kurios skirtos uždavinių paruošimui ir vykdymui. Tuo tarpu labai svarbu tinkamai saugoti jau atliktus skaičiavimus. Tam, kad vartotojas galėtų lengviau pasiekti ir redaguoti tuos duomenis, yra naudojamos informacinės sistemos, kurios palengvina darbą su duomenų bazėmis –pateikiama paprasta aplinka duomenims įkelti, tvarkyti, trinti ir atvaizduoti. Skirtingi kvantinės chemijos programų paketai turi didelį kiekį skirtingų skaičiavimo algoritmų, iš kurių vieni sutampa, o kiti skiriasi. Darbo tikslas automatizuoti ir pritaikyta kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų leidimui, saugojimui, jų automatizuotai analizei ir turėtų informacinę sistemą, kurioje daugelis vartotojų (šiuo metu pritaikyta vienam vartotojui) gali lengvai pasiekti bei tvarkyti kvantinių skaičiavimų duomenis. Įdiegti vieną pasirinktą kvantinės chemijos paketą ir atlikti našumo testus. Skaičiavimai bus atliekamai superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
9.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Įvairių baltymų modeliavimas su karotinoidais panaudojant pasirinktą kantinės chemijos paketą Modeling of Various Carotenoids with Protein using chosen quantum chemistry package	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Karotinoidų savybės priklauso nuo baltyminės aplinkos, kuri yra kintanti laike, todėl reikalingas detalus sistemos aprašymas norint suprasti spektrines savybes, o tam reikalingi paketų našumo analizės tyrimai, tokių kaip NwChem, Orca, Quantum ESPRESSO ir kt.. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant pasirinktą paketą. Reikės įdiegti paketą, įgyti kompiliavimo žinių su C++/FORTRAN/Java/Python ir atlikti našumo tyrimus. Atlikti ab initio skaičiavimus karotinoidams esantiems baltyminėje aplinkoje su pasiriktu paketais. Reiks atlikit superkompiuterio našumo analizę ir paruošti paketo naudojimo instrukcijas. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis.	Laisva
10.	Darius Abramavičius, , Saulėtekio al. 3, A312, Tel. (8 5) 223 4544	Eksitonų dinamikos ir disociacijos modeliavimas organiniuose saulės elementuoseModeling of excitation dynamics and charge separation in organic solar cells	Organiniai saulės elementai yra netvarkios medžiagos sudarytos iš donorinių ir akceptorinių molekulinių chromoforų. Naudojant fenomenologinį stipraus ryšio modelį bus modeliuojama sužadinimo kvantinė dinamika ir disociacija	laisva
11.	Kristijonas Genevičius tel.: 85 233 4553	HOMO lygmenų nustatymas organiniuose puslaidininkiuose PYS metodu Determination of the HOMO energy in organic semiconductors by PYS	Fotoemisijos išeigos spektroskopijos būdų bus nustatomi naujų medžiagų skirtų saulės elementams HOMO energetiniai lygmenys ir molekulinės struktūros įtaka HOMO lygmens padėčiai	užimta ?
12.	Kristijonas Genevičius tel.: 85 233 4553	Krūvininkų pernašos ir rekombinacijos modeliavimas baigtinių elementų metodu Numerical modeling of charge carriers transport and recombination by finite element method	Pasitelkus Matlab arba (ir) C++ baigtiniu elementų metodu (1D) bus skaitmeniškai modeliuojamas krūvininkų judėjimas bei rekombinacija, esant skirtingiems žadinimo intensyvumams, apkrovos varžai bei skirtingiems bimolekulinės rekobinacijos koeficientams	užimta ?

Baigiamasis darbas (IV k. Šviesos technologijos)

Eil. Nr.	Vadovas (vadovo el. p., darbo tel. nr.)	Temos pavadinimas (lietuvių ir anglų kalbomis)	Trumpas temos aprašymas (lietuvių ir anglų kalbomis)	Tema laisva/užimta
1.	dr. Rokas Dobužinskas (, 8 662 38767)	Biologinių sistemų tyrimas veikiant jonizuojančia spinduliuote Ivestigation of Biological Systems Exposed to Ionising Radiation	Gyvieji organizmai veikiami natūralaus radiacinio fono, kuris nuolat daro pažeidimus biologinėse sistemose. Ląstelės turi apsisaugojimo mechanizmus, kurie leidžia atstatyti sukurtus pokyčius. Mokslo šaka, tyrinėjanti jonizuojančios spinduliuotės veikimą gyvybei yra ganėtinai sena, tačiau tikslūs biologiniai ir fizikiniai mechanizmai vis dar nėra iki galo ištirti. Šiuo darbu bandysime taikyti naujus elektrinius metodus ir gilintis į fizikinius mechanizmus, kurie galėtų paaiškinti biologinių sistemų veikimą	Laisva
2.	dr. Rokas Dobužinskas (, 8 662 38767)	Riebalų rugščių kristalitų gamyba ir jų fizikinių savybių tyrimas Production of fatty acid crystallites and investigation of their physical properties	Gyvoje gamtoje išgaunamos riebalų rūgštys, kurios geba sudaryti kietas kristalines formas, šiuo metu plačiausiai pritaikomos maisto pramonėje – šokolado gamyboje. Šokolado gaminiai yra išgaunami specialiomis temperavimo technologijomis išgaunant stabiliausią, kuo aukštesnėje temperatūroje besilydančią ir mechaniškai kiečiausią kristalinę formą. Šiame darbe bus gaminami riebalų rūgščių kristalitai ir tiriamos jų fizikinės savybės. Pagaminti kristalai bus analizuojami rentgeno spindulių difrakcija (naujuoju Rigaku SmartLab prietaisu)	Laisva
3.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	NASICON tipo kompozitinių medžiagų, skirtų baterijų taikymams, kietojo kūno BMR spektroskopija Solid state NMR of NASICON based materials for sodium batteries	Tirsime kietojo kūno BMR metodais medžiagas, kurios yra skirtos natrio baterijoms. Tokios baterijos gali būti panaudotos elektros tinklo stabilizavimo poreikiams tenkinti.	Laisva
4.	Dr. Vytautas Klimavičius, (8 5) 223 4588	Kalcio fosfatų, skirtų kaulų audinių inžinerijai, kietojo kūno BMR spektroskopija Solid state NMR of calcium phosphates for bone tissue engineering	Tirsime kietojo kūno BMR metodais kalcio fosfatų pagrindu pagamintas medžiagas. Jos yra skirtos kaulų inžinerijai, nes primena kietuosius kaulinius audinius.	Laisva
5.	Gytis Sliaužys (, 8 5 223 4553)	Krūvininkų pernašos savybių tyrimas organiniuose lauko tranzistoriuose Investigation of charge carriers transport properties in organic field-effect transistors	Šio darbo tikslas: pasigaminti organinius lauko tranzistorius naudojant skirtingus organinius puslaidininkius; skirtingomis metodikomis ištirti, šių puslaidininkių, krūvio pernašos savybes organiniuose lauko tranzistoriuose; iš gautų rezultatų nustatyti naudotų organinių puslaidininkių tinkamumą organiniams lauko tranzistoriams	Laisva
6.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Aleno karotinoidų krūvio pernašos būsenų modeliavimas Charge transfer state modeling for allene carotenoids	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Aleno karotinoidai pasižymi papildoma krūvio pernašos būsena, kuri vizualiai priklauso nuo molekulės cheminė struktūros. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes. Reikės modeliuoti struktūras, atlikti kvantinę molekulių dinamiką. Atlikti MD skaičiavimus su naujausiu AMBER paketu ir ab initio skaičiavimus su Gaussian 16 ir NwChem ir kitais įsisavintais paketais. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
7.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Įvairių baltymų modeliavimas su karotinoidais panaudojant GROMACS paketą Modeling of Various Carotenoids with Protein using GROMACS package	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Karotinoidų savybės priklauso nuo baltyminės aplinkos, kuri yra kintanti laike, todėl reikalingas detalus sistemos aprašymas norint suprasti spektrines savybes, o tam reikalingi paketų našumo analizės tyrimai, tokių kaip GROMACS. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant GROMACS ir Gaussian 16 paketus. Reikės įdiegti GROMACS paketą, atlikti našumo tyrimus. Atlikti ab initio skaičiavimus karotinoidams esantiems baltyminėje aplinkoje su Gaussian 16 ir GROMACS paketais. Reiks atlikit superkompiuterio našumo analizę ir paruošti GROMACS naudojimo instrukcijas. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
8.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų duomenų bazė ir informacinė sistema The Database and Information System for the results of the Quantum Chemical calculations	Superkompiuterių kvantinės chemijos panaudojimo efektyvumui naudojamos sistemos kaip WebMO, kurios skirtos uždavinių paruošimui ir vykdymui. Tuo tarpu labai svarbu tinkamai saugoti jau atliktus skaičiavimus. Tam, kad vartotojas galėtų lengviau pasiekti ir redaguoti tuos duomenis, yra naudojamos informacinės sistemos, kurios palengvina darbą su duomenų bazėmis –pateikiama paprasta aplinka duomenims įkelti, tvarkyti, trinti ir atvaizduoti. Skirtingi kvantinės chemijos programų paketai turi didelį kiekį skirtingų skaičiavimo algoritmų, iš kurių vieni sutampa, o kiti skiriasi. Darbo tikslas automatizuoti ir pritaikyta kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų leidimui, saugojimui, jų automatizuotai analizei ir turėtų informacinę sistemą, kurioje daugelis vartotojų (šiuo metu pritaikyta vienam vartotojui) gali lengvai pasiekti bei tvarkyti kvantinių skaičiavimų duomenis. Įdiegti vieną pasirinktą kvantinės chemijos paketą ir atlikti našumo testus. Skaičiavimai bus atliekamai superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
9.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Įvairių baltymų modeliavimas su karotinoidais panaudojant pasirinktą kantinės chemijos paketą Modeling of Various Carotenoids with Protein using chosen quantum chemistry package	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose. Karotinoidų savybės priklauso nuo baltyminės aplinkos, kuri yra kintanti laike, todėl reikalingas detalus sistemos aprašymas norint suprasti spektrines savybes, o tam reikalingi paketų našumo analizės tyrimai, tokių kaip NwChem, Orca, Quantum ESPRESSO ir kt.. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotinoidų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant pasirinktą paketą. Reikės įdiegti paketą, įgyti kompiliavimo žinių su C++/FORTRAN/Java/Python ir atlikti našumo tyrimus. Atlikti ab initio skaičiavimus karotinoidams esantiems baltyminėje aplinkoje su pasiriktu paketais. Reiks atlikit superkompiuterio našumo analizę ir paruošti paketo naudojimo instrukcijas. Skaičiavimai bus atliekami su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
10.	K. Genevičius tel.: 85 233 4553	Skersaryšinimo įtaka krūvininkų pernašai ir rekombinacijai tūrinėse heterosandūrose Effect of cross-linking on charge carriers transport and recombination in bulk heterojunctions	Bus gaminamos tūrinės heterosandūros su skersaryšinamomis medžiagomis ir tiriama krūvininkų pernaša prieš ir po skersaryšinimo lėkio trukmės bei CELIV metodikomis. Heterostruktūrų gamyba ir eksperimentas Bulk heterostruktures with cross-linkable materials will be fabricated and the charge carriers transport before and after cross-linking will be investigated using time-of-flight and CELIV techniques. Fabrication of heterojunctions and experiment	užimta ?
11.	K. Genevičius tel.: 85 233 4553	Bimolekulinės rekombinacijos koeficiento nustatymas lėkio trukmės metodu paviršinės sugerties atveju Determination of the bimolecular recombination coefficient by the time-of-flight technique in the case of surface absorption	Bimolekulinės rekombinacijos koeficiento nustatyto lėkio trukmės metodu priklausomybė nuo storio, gautų rezultatų palyginimas su CELIV matavimais ir Lanžaveno koeficientu. Bandinių gamyba ir eksperimentas. Dependence of the bimolecular recombination coefficient determined by the time-of-flight method with thickness and comparison of the results with CELIV measurements and Langevin coefficient. Sample fabrication and experiment	užimta ?

Mokslo tiriamasis darbas I (M1 Teorinė fizika ir astrofizika)

Eil. Nr.	Vadovas (vadovo el. p., darbo tel. nr.)	Temos pavadinimas (lietuvių ir anglų kalbomis)	Trumpas temos aprašymas (lietuvių kalba)	Tema laisva/užimta
1.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Karotenporfirino dyadų būsenų modeliavimas naudojant tankio funkcionalus ir molekulių dinamiką Carotenoporphyrin Dyad Modeling with DFT and Molecular Dynamics	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose, kurie sudaro kompleksus su chlorofilais. Viena tokių dirbtinių sistemų yra karotenporfirino dyados, kuriose vyksta analogiški fotofizikiniai procesai. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotenporfirino dyadų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant tankio funkcionalo metodikas. Reikės atlikti ab initio skaičiavimus, kad įvertinti galimai susidarančias krūvio pernašos būsenas. Skaičiavimai bus atliekamai su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
2.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Bakteriorodopsino aktyvaus centro retinalio molekulės molekulių dinamikos skaičiavimai Bacteriorhodopsin active center Retinal molecule study with molecular dynamics	Kvantinės chemijos metodai, tokie kaip DFT, kartu su molekulių mechanika, panaudojant superkompiuterių resursus, leidžia modeliuoti dideles molekulines struktūras, baltymus. Naudojant DFT metodiką galima modeliuoti retinalio molekulę ir Bakteriorodopsino baltymą. Bakteriorodopsino baltymas yra eksperimentiškai tiriamas vienas iš modelinių sistemų, kurią sudaro opsino baltymas ir retinalio molekulė. Baltymas pumpuoja protonus, po to kai retinalis sugeria matomą šviesą. Retinalio molekulė struktūriškai yra puse tipinės karotinoido (betakaroteno) molekulės, kurių spektrinės savybes daugiausia nulemtos polyeninės grandinėlės. Visgi Retinalio sužadintos energijos visiškai skiriasi tiek nuo tipinių karotinoidų, tiek nuo polieno molekulių. Darbo tikslas ištirti kaip ir kurios retinalio struktūrinės dalys nulemia kitokias spektrines savybes, bei kaip molekulei daro įtaką aplinkui esanti baltymo struktūra. Darbe reikės paruošti 2 tūkst. atomų baltymų struktūras molekulių dinamikai, išskirti aktyvų centrą. Atlikti DFT skaičiavimus su Gaussian 16 arba kitu įsisavintu paketu. Skaičiavimai bus atliekamai su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
3.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	DNR kirpimo mechanizmo tyrimas tankio funkcionalų metodais su superkompiuteriu DNA Restriction endonuclease cleavage mechanisms DFT study using supercomputers	BCNI baltymas atpažįsta ir nukerpa tam tikras DNR sekas. Atpažinimo ir kirpimo mechanizmas nėra suprastas, tad reikalingas QM/MM modeliavimas. Darbo tikslas ištirti kaip ir kurios DNR struktūrinės dalys sudaro ryšius su BcnI baltymu. Darbo rezultatai patikslins apytiksliai žinomas BCNI aktyvių centrų atomų padėtis, bei kur ir kokie susidaro ryšiai tarp DNR ir BcnI baltymo. Darbe reikės paruošti apie 2 tūkst. atomų baltymų struktūras AMBER paketui. Atlikti DFT skaičiavimus su Gaussian 16 paketu. Skaičiavimai bus atliekamai superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
4.	Doc. dr. Kęstutis Aidas, , 8 5 223 4593	Makromolekulinėse matricose inskapsuliuotų molekulių struktūros ir BMR spektrų modeliavimas Modelling structural and NMR properties of molecules bound to supramolecular cavitands	Supramolekulinių darinių tyrimai šiuo metu yra itin aktyvi mokslinės veiklos. Įdomu tai, kad molekulėms prisijungus vadinamųjų supramolekulinių kavitandų ertmėse, šių molekulių savybės gali pasikeisti drastiškai – gali būti stabilizuojamos įprastai energetiškai nepalankios konformacijos, inicijuojamos egzotiškos cheminės reakcijos, ar padidinamas šiaip vandenyje netirpių molekulių tirpumas. Šios molekulinės sistemos labai perspektyvios, nes gali būti panaudojamos, pavyzdžiui, kaip vaistinių junginių nešikliai arba kaip selektyvūs biomolekulių jutikliai. Norint plėsti supramolekulinių kavitandų taikymo galimybes, būtina detaliai suprasti molekulės-kavitando komplekso struktūrą bei kavitanduose inkapsuliuotų molekulių elgseną molekuliniame lygmenyje. Šiame darbe bus modeliuojami molekulių, inkapsuliuotų supramolekuliniuose kavitanduose, struktūra ir branduolių magnetinio rezonanso spektrai taikant modernius molekulinių sistemų modeliavimo metodus – klasikines molekulinės dinamikos simuliacijas ir jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos modelius. Visi modeliavimo darbai bus atliekami VU aukšto našumo skaičiavimo centro „HPC Saulėtekis“ superkompiuteriu	Laisva
5.	Doc. dr. Kęstutis Aidas, , 8 5 223 4593	Joninių skysčių mišiniai su tradiciniais tirpikliais: struktūros ir BMR spektrų modeliavimas Modelling structural and NMR properties of mixtures between ionic liquids and traditional solvents	Joniniai skysčiai yra modernios, itin aktyviai tyrinėjamos medžiagos, sudarytos vien tik iš organinių molekulinių katijonų ir organinių arba neorganinių anijonų. Kadangi katijonų molekulinė struktūra pasižymi tam tikra asimetrija, dažnai JS, – kitaip nei įprastinės druskos, – išlieka skysti kambario ar netgi dar žemesnėje temperatūroje. Dėl savo išskirtinės sudėties šie skysčiai pasižymi unikaliomis savybėmis, kurios atveria duris įvairialypiams jų taikymams cheminėje inžinerijoje, gyvybės moksluose ir nanotechnologijose. Siekiant suprasti ir kontroliuoti joninių skysčių fiziko-chemines savybes, būtina turėti detalią informaciją molekuliniame lygmenyje apie šių sistemų tarpmolekulinę struktūrą ir dinamiką. Šiame darbe bus modeliuojami imidazolio katijono šeimos joninių skysčių ir dichlormetano mišinių struktūra ir branduolių magnetinio rezonanso spektrai taikant modernius molekulinių sistemų modeliavimo metodus – klasikines molekulinės dinamikos simuliacijas ir jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos modelius. Visi modeliavimo darbai bus atliekami VU aukšto našumo skaičiavimo centro „HPC Saulėtekis“ superkompiuteriu	Laisva
	Darius Abramavičius, , Saulėtekio al. 3, A312, Tel. (8 5) 223 4544	Eksitonų dinamikos ir disociacijos modeliavimas organiniuose saulės elementuose / fotosintetiniuose kompleksuose Modeling of excitation dynamics and charge separation in organic solar cells/photosynthetic complexes	Organiniai saulės elementai yra netvarkios medžiagos sudarytos iš donorinių ir akceptorinių molekulinių chromoforų. Tokiu pačiu principu veikia fotosintetiniai molekulių kompleksai. Elektron-fononiniai sklaidos procesai apsprendžia elektronų ir skylių termalizaciją, disociaciją ir rekombinaciją. Šie procesai bus modeliuojami defektų aplinkoje	laisva

Mokslo tiriamasis darbas II (M2 k. Elektronika ir telekomunikacijų technologijos, M2 Fotonika ir nanotechnologijos, M2 Gyvybės ir cheminė fizika, M2 Lazerinė fizika ir optinės technologijos, M2 Lazerinė technologija, M2 Teorinė fizika ir astrofizika)

Mokslo tiriamasis darbas II (M2 k. Elektronika ir telekomunikacijų technologijos, M2 Fotonika ir nanotechnologijos, M2 Gyvybės ir cheminė fizika, M2 Lazerinė fizika ir optinės technologijos, M2 Lazerinė technologija, M2 Teorinė fizika ir astrofizika)

Eil. Nr.	Vadovas (vadovo el. p., darbo tel. nr.)	Temos pavadinimas (lietuvių ir anglų kalbomis)	Trumpas temos aprašymas (lietuvių kalba)	Tema laisva/užimta
1.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Karotenporfirino dyadų būsenų modeliavimas naudojant tankio funkcionalus ir molekulių dinamiką Carotenoporphyrin Dyad Modeling with DFT and Molecular Dynamics	Karotinoidai yra paplitę yra paplitę gyvojoje gamtoje, kurių savybės išnaudojamos įvairiuose procesuose, kurie sudaro kompleksus su chlorofilais. Viena tokių dirbtinių sistemų yra karotenporfirino dyados, kuriose vyksta analogiški fotofizikiniai procesai. Darbo tikslas skaičiuoti įvairių karotenporfirino dyadų struktūrines ir spektrines savybes, naudojant tankio funkcionalo metodikas. Reikės atlikti ab initio skaičiavimus, kad įvertinti galimai susidarančias krūvio pernašos būsenas. Skaičiavimai bus atliekamai su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
2.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	Bakteriorodopsino aktyvaus centro retinalio molekulės molekulių dinamikos skaičiavimai Bacteriorhodopsin active center Retinal molecule study with molecular dynamics	Kvantinės chemijos metodai, tokie kaip DFT, kartu su molekulių mechanika, panaudojant superkompiuterių resursus, leidžia modeliuoti dideles molekulines struktūras, baltymus. Naudojant DFT metodiką galima modeliuoti retinalio molekulę ir Bakteriorodopsino baltymą. Bakteriorodopsino baltymas yra eksperimentiškai tiriamas vienas iš modelinių sistemų, kurią sudaro opsino baltymas ir retinalio molekulė. Baltymas pumpuoja protonus, po to kai retinalis sugeria matomą šviesą. Retinalio molekulė struktūriškai yra puse tipinės karotinoido (betakaroteno) molekulės, kurių spektrinės savybes daugiausia nulemtos polyeninės grandinėlės. Visgi Retinalio sužadintos energijos visiškai skiriasi tiek nuo tipinių karotinoidų, tiek nuo polieno molekulių. Darbo tikslas ištirti kaip ir kurios retinalio struktūrinės dalys nulemia kitokias spektrines savybes, bei kaip molekulei daro įtaką aplinkui esanti baltymo struktūra. Darbe reikės paruošti 2 tūkst. atomų baltymų struktūras molekulių dinamikai, išskirti aktyvų centrą. Atlikti DFT skaičiavimus su Gaussian 16 arba kitu įsisavintu paketu. Skaičiavimai bus atliekamai su superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
3.	Doc. dr. Mindaugas Mačernis Tel. +370 5 223 4659 El.p. http://www.supercomputing.ff.vu.lt	DNR kirpimo mechanizmo tyrimas tankio funkcionalų metodais su superkompiuteriu DNA Restriction endonuclease cleavage mechanisms DFT study using supercomputers	BCNI baltymas atpažįsta ir nukerpa tam tikras DNR sekas. Atpažinimo ir kirpimo mechanizmas nėra suprastas, tad reikalingas QM/MM modeliavimas. Darbo tikslas ištirti kaip ir kurios DNR struktūrinės dalys sudaro ryšius su BcnI baltymu. Darbo rezultatai patikslins apytiksliai žinomas BCNI aktyvių centrų atomų padėtis, bei kur ir kokie susidaro ryšiai tarp DNR ir BcnI baltymo. Darbe reikės paruošti apie 2 tūkst. atomų baltymų struktūras AMBER paketui. Atlikti DFT skaičiavimus su Gaussian 16 paketu. Skaičiavimai bus atliekamai superkompiuteriu „VU HPC“ Saulėtekis	Laisva
4.	Doc. dr. Kęstutis Aidas, , 8 5 223 4593	Makromolekulinėse matricose inskapsuliuotų molekulių struktūros ir BMR spektrų modeliavimas Modelling structural and NMR properties of molecules bound to supramolecular cavitands	Supramolekulinių darinių tyrimai šiuo metu yra itin aktyvi mokslinės veiklos. Įdomu tai, kad molekulėms prisijungus vadinamųjų supramolekulinių kavitandų ertmėse, šių molekulių savybės gali pasikeisti drastiškai – gali būti stabilizuojamos įprastai energetiškai nepalankios konformacijos, inicijuojamos egzotiškos cheminės reakcijos, ar padidinamas šiaip vandenyje netirpių molekulių tirpumas. Šios molekulinės sistemos labai perspektyvios, nes gali būti panaudojamos, pavyzdžiui, kaip vaistinių junginių nešikliai arba kaip selektyvūs biomolekulių jutikliai. Norint plėsti supramolekulinių kavitandų taikymo galimybes, būtina detaliai suprasti molekulės-kavitando komplekso struktūrą bei kavitanduose inkapsuliuotų molekulių elgseną molekuliniame lygmenyje. Šiame darbe bus modeliuojami molekulių, inkapsuliuotų supramolekuliniuose kavitanduose, struktūra ir branduolių magnetinio rezonanso spektrai taikant modernius molekulinių sistemų modeliavimo metodus – klasikines molekulinės dinamikos simuliacijas ir jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos modelius. Visi modeliavimo darbai bus atliekami VU aukšto našumo skaičiavimo centro „HPC Saulėtekis“ superkompiuteriu	Laisva
5.	Doc. dr. Kęstutis Aidas, , 8 5 223 4593	Joninių skysčių mišiniai su tradiciniais tirpikliais: struktūros ir BMR spektrų modeliavimas Modelling structural and NMR properties of mixtures between ionic liquids and traditional solvents	Joniniai skysčiai yra modernios, itin aktyviai tyrinėjamos medžiagos, sudarytos vien tik iš organinių molekulinių katijonų ir organinių arba neorganinių anijonų. Kadangi katijonų molekulinė struktūra pasižymi tam tikra asimetrija, dažnai JS, – kitaip nei įprastinės druskos, – išlieka skysti kambario ar netgi dar žemesnėje temperatūroje. Dėl savo išskirtinės sudėties šie skysčiai pasižymi unikaliomis savybėmis, kurios atveria duris įvairialypiams jų taikymams cheminėje inžinerijoje, gyvybės moksluose ir nanotechnologijose. Siekiant suprasti ir kontroliuoti joninių skysčių fiziko-chemines savybes, būtina turėti detalią informaciją molekuliniame lygmenyje apie šių sistemų tarpmolekulinę struktūrą ir dinamiką. Šiame darbe bus modeliuojami imidazolio katijono šeimos joninių skysčių ir dichlormetano mišinių struktūra ir branduolių magnetinio rezonanso spektrai taikant modernius molekulinių sistemų modeliavimo metodus – klasikines molekulinės dinamikos simuliacijas ir jungtinius kvantinės mechanikos/molekulinės mechanikos modelius. Visi modeliavimo darbai bus atliekami VU aukšto našumo skaičiavimo centro „HPC Saulėtekis“ superkompiuteriu	Laisva
6.	dr. Stepas Toliautas (85) 223 4661	Molekulinių skaičiavimų duomenų analizės efektyvumas naudojant paskirstytuosius resursus Efficiency of Distributed Data Analysis of the Results of Molecular Computations		Aleksandr Ivanov MTD III
7.	dr. Stepas Toliautas (85) 223 4661	Fotoaktyvios molekulės struktūros įvertinimas skirtingo dydžio polimerų tirpaluose Structure estimation of a photoactive molecule in varying-size polymer solutions		Domantas Narkevičius MTD III

2022/2023 m. m. pavasario semestro kursinių ir mokslo tiriamųjų darbų gynimai Cheminės fizikos institute

Institutas,

atsakingas asmuo

Kursinių darbų bakalaurams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Mokslo tiriamųjų darbų magistrantams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Cheminės fizikos institutas

(Julija Gorbaniova,

tel. (8 5) 223 4560,

el.p. )

2023-06-22, 14 – 15 val., NFTMC, Saulėtekio al. 3, D401 (bendra komisija)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-06-20

adresu

2023-06-22, 9 – 12 val., NFTMC, Saulėtekio al. 3, D401 (bendra komisija)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-06-20

adresu

2022/2023 m. m. pavasario semestro baigiamųjų darbų gynimai Cheminės fizikos institute

Institutas,

atsakingas asmuo

Baigiamųjų darbų bakalaurams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Baigiamųjų darbų magistrantams gynimo data, laikas ir vieta

(Kaip Rašto darbas pateikiamas iki gynimo atsakingam asmeniui)

Cheminės fizikos institutas

(Julija Gorbaniova,

tel. (8 5) 223 4560,

el.p. )

I. 2023-05-25, 10 – 14 val., NFTMC, B336

Molekulių spektroskopijos grupė

(prof. V. Šablinskas)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-05-22, 13 val.

adresu

II. 2023-05-26, 13 val., FF 311 kab.

Molekulių teorijos ir modeliavimo grupė

(prof. D. Abramavičius)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-05-24, 16 val.

adresu

III. 2023-05-26, 10 – 13 val., NFTMC, B336

Kietojo kūno elektronikos grupė

(dr. K. Genevičius)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-05-24, 12 val.

adresu

I. 2023-05-25, 10 – 14 val., NFTMC, B336

Molekulių spektroskopijos grupė (prof. V. Šablinskas)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-05-22, 13 val.

adresu

II. 2023-05-26, 13 val., FF 311 kab.

Molekulių teorijos ir modeliavimo grupė

(prof. D. Abramavičius)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-05-24, 16 val.

adresu

III. 2023-05-26, 10 – 13 val. NFTMC, B336

Kietojo kūno elektronikos grupė

(dr. K. Genevičius)

Darbus atsiųsti:

pdf formatu iki 2023-05-24, 12 val.

adresu

Siūlomos 2021-2022 m.m. pavasario semestro profesinės praktiko ir mokslo tiriamųjų darbų temos

Siūlomos M1 2021 m. mokslo tiriamosios praktikos temos

2020 – 2021 m.m. Cheminės fizikos institute siūlomos darbų temos visų pakopų studentams

Rašto darbų rengimo ir gynimo taisyklės

Jeigu darbo vadovas yra ne Fizikos fakulteto darbuotojas, šio darbo rašymui turi būti paskirtas konsultantas iš Fizikos fakulteto, kurio pavardė nurodoma darbo tituliniame lape.
Papildomą informaciją kaip teisingai apiforminti rašto darbą galima rasti profesoriaus Prano Juozo Žilinsko knygoje „Rašto darbai. Ką būtina žinoti rengiant tiksliųjų mokslų rašto darbą“.
Profesoriaus Prano Juozo Žilinsko knygoje „Rašto darbai. Ką būtina žinoti rengiant tiksliųjų mokslų rašto darbą“ aptariami pateikiamų ginti tiksliųjų mokslų rašto darbų reikalavimai. Joje aiškinama, kaip reikėtų rašyti referatus, kursinius, baigiamuosius ir kitus darbus, kokių reikalavimų privalo laikytis studentai, atlikdami laboratorinius darbus, kaip juos turi sutvarkyti, kaip taisyklingai turėtų būti rašomos matematinės formulės, fizikinių dydžių simboliai, matavimo vienetai ir pan., taip pat dėstoma, kaip sudaromos lentelės, braižomos diagramos, schemos, koks turi būti rašto darbo bibliografijos apipavidalinimas.

Leidinys skiriamas studentams ir doktorantams, atliekantiems teorinius ir eksperimentinius darbus ir norintiems tinkamai juos aprašyti.

Sidebar

Baigiamųjų darbų svarstymai Cheminės fizikos institute 2023/2024 m. m. pavasarį

Cheminės fizikos institutas