Superkompiuteris
„VU HPC“ Saulėtekis
- Našumo analizė
Mindaugas Macernis, Vaidotas Mickus, Janne Ahonen, Laurynas Diska, Jonas Franukevicius, Juozas Sulskus "Still Unsolved High-Performance Computing Challenges for up to Pre-Petascale Homogeneous Supercomputers" arXiv preprint arXiv:2210.00934, 2022 -
Paskirstytos atminties klasteris
Iš viso maksimalus panaudojimas 143 skaičiavimo mazgai vienam uždaviniui (viename mazge yra 64 skaičiavimo branduoliai su AVX-512, AVX2 AVX, SSE4.2 procesoriaus instrukcijomis, 376 GB RAM). Tikėtinas fizinis skaičiavimo mazgų prieinamumas: 80%.
Mazgai apjungti 100 Gbps greičio IB tinklu su kitais mazgais klasterio mazgais ir klasteriais.
Visa sistema naudoja didelio našumo failinę sistemas: 46TB (100 Gbps greičio IB tinkle) ir 289 TB (40 Gbps greičio IB tinkle). Maksimalus failo dydis uždaviniui 200TB.
Užduočių eilės: SLURM
Operacinės sistema: Red Hat Enterprise Linux release 8.4
Architektūra: Sequana X1000.
Panaudojimo galimybės:
OpenMP ir MPI tipo skaičiavimai pasirenkant uždaviniui reikalingą mazgų, branduolių ir atminties kiekį, Linux RHEL8 aplinkoje. Virtuali mašina su Windows aplinka pagal specialius poreikius.
- GPU skaičiavimo mazgai
Viename mazge (2 vnt) yra 64 skaičiavimo branduoliai su AVX-512, AVX2 AVX, SSE4.2 procesoriaus instrukcijomis; 4 Tesla V100 GPU kortos, 376 GB RAM. Mazgai apjungti IB tinklu. Tikėtinas fizinis skaičiavimo mazgų prieinamumas: 50%.
Mazgai apjungti 100 Gbps greičio IB tinklu su kitais mazgais klasterio mazgais ir klasteriais.
Visa sistema naudoja didelio našumo failinę sistemas: 46TB (100 Gbps greičio IB tinkle) ir 289 TB (40 Gbps greičio IB tinkle). Maksimalus failo dydis uždaviniui 200TB.
Užduočių eilės: SLURM
Operacinės sistema: Red Hat Enterprise Linux release 8.4
Architektūra: Sequana X1000.
Panaudojimo galimybės:
OpenMP ir MPI tipo skaičiavimai su NVidia GPU technologija pasirenkant uždaviniui reikalingą mazgų, branduolių ir atminties kiekį, Linux RHEL8 aplinkoje.
Superkompiuterio „VU HPC Saulėtekis“ klasteris BullSequana X1000
- Kita informacija
Diegimas. Naujiena paskelbta 2020-06-25: https://naujienos.vu.lt/vu-atsivers-iki-siol-dar-nematytos-galimybes-pasirasytos-sutartys-del-naujo-superkompiuterio-irengimo/
Viešinimas: https://www.vu.lt/projektai/lietuvos-grid-nasiu-skaiciavimu-tinklas-litgrid-hpc/
Istorija: Fizika 2000
“HPC Saulėtekis” skirtas VU, Lietuvos Nacionalinio fizinių technologijų mokslų centro, kitų Lietuvos mokslo institucijų mokslininkų darbams.
Centro tikslas yra paskatinti studentus ir mokslininkus naudoti aukšto našumo skaičiavimus moksliniuose darbuose, dalyvauti bendruose Europos mokslinių tyrimų projektuose panaudojant dar našesnę infrastruktūrą, pvz. PRACE projekte.
HPC Saulėtekis buvo kuriamas siekiant sudaryti sąlygas spręsti santykinai labai didelių resursų reikalaujančius medžiagotyros, kvantinės chemijos, astrofizikos it kitus uždavinius. Šios infrastruktūros privalumas – beveik visus superkompiuterio resursus galima panaudoti vienam uždaviniui, kurio sprendimas trunka kelias ir daugiau savaičių.
Superkompiuterio resursus konkurso tvarka gali naudoti visi, ne tik Lietuvos, vartotojai sutinkamai su VU atviros prieigos centrų taisyklėmis. Šiuo metu didžiausias galimas uždavinys – tai 25.7 TFlop su 15 TB RAM.
Aukšto našumo atviros prieigos skaičiavimo centras „HPC Saulėtekis“ yra Nacionalinio fizinių ir technologijos mokslų centro infrastruktūros dalis. Superkompiuterių įranga yra įsigyta Europos Sąjungos lėšomis 2006 m. ir 2011 m.
Tyrimai
2024 publikacijos
- Venckus, J.; Povilaitis, M., The role of CFD combustion modelling in hydrogen safety management — IX: Validation of ETFC model implementation in flameFoam for large-scale hydrogen-air-steam deflagration. Nuclear Engineering and Design 2025, 432, 113737. (Q1)
- Maciaszek, M.; Razinkovas, L., Blue Quantum Emitter in Hexagonal Boron Nitride and a Carbon Chain Tetramer: a First-Principles Study. ACS Applied Nano Materials 2024, 7 (16), 18979-18985. (Q2)
- Silkinis, R.; Žalandauskas, V.; Thiering, G.; Gali, A.; Van de Walle, C. G.; Alkauskas, A.; Razinkovas, L., Optical lineshapes for orbital singlet to doublet transitions in a dynamical Jahn-Teller system: The ${\mathrm{NiV}}^{\ensuremath{-}}$ center in diamond. Physical Review B 2024, 110 (7), 075303. (Q2)
- Rankelytė, G.; Gelzinis, A.; Robert, B.; Valkunas, L.; Chmeliov, J., Environment-dependent chlorophyll–chlorophyll charge transfer states in Lhca4 pigment–protein complex. Frontiers in Plant Science 2024, 15.(Q1)
- Barysaitė, S.; Chmeliov, J.; Valkunas, L.; Gelzinis, A., Concentration Quenching of Fluorescence Decay Kinetics of Molecular Systems. The Journal of Physical Chemistry B 2024, 128 (20), 4887-4897. (Q3)
- Halimski, I.; Karpicz, R.; Dementjev, A.; Jankunec, M.; Chmeliov, J.; Macernis, M.; Abramavicius, D.; Valkunas, L.,
trans-Stilbene aggregates and crystallites in polystyrene films: microscopy and spectroscopy studies. Physical Chemistry Chemical Physics 2024 (Q2) - G. Usevičius, J. Turčak, Y. Zhang, A. Eggeling, Ž. Einorytė, M.A. Hope, Š. Svirskas,
D. Klose, V. Kalendra, K. Aidas, G. Jeschke, J. Banys, M. Šimėnas.
Probing structural and dynamic properties of MAPbCl3 hybrid perovskite using Mn2+
EPR. Dalton Trans. 53 (2024), 7292. (Q1) - Tamuliene, J., & Kirova, T. (2024). Discrimination of leucine and isoleucine via fragmentation by electromagnetic field. Journal of Molecular Modeling, 30(1), 11 (Q3,HPC).
- Stocka, J., Platakyte, R., Macyte, J., Sablinskas, V., Rodziewicz, P., & Guirgis, G. A. (2024). Influence of heteroatoms and substituents on structural and spectroscopic parameters of saturated six-member ring heterocycles: experimental and theoretical study of 1-methyl-1-germacyclohexane. Journal of Molecular Structure, 1296, 136766 (Q2,HPC).
- Narkevičius, D., & Toliautas, S. (2024). Predicting nonradiative decay barrier of BODIPY dye in polar environment by applying ONIOM multiscale method. Lithuanian Journal of Physics, 64(1) (Q4,HPC)
Q1/Q2: 6+
2024 projektai
- „Industry 4.0 Lab platforma: EDIH VILNIUS“ Nr. 02-016-P-0002. VU dalies vadovas prof. Juozas Šulskus.
-
„Optiškai jautrių molekulių agregacijos ir spektroskopinių savybių modeliavimas“ LMT mokslininkų grupių projektas nr. S-MIP-23-48 (2023-2026) vadovas prof. Darius Abramavičius.
-
National Competence Centres in the framework of EuroHPC Phase 2 – EuroCC 2 (DIGITAL-EUROHPC-JU-2022-NCC-01-01), vadovas doc. Mindaugas Mačernis (VU). 2023-2026
-
LMT mokslininkų grupių projektas nr. S-MIP-22-74 “Bioaktyvių joninių skysčių struktūrinių ir BMR spektrinių parametrų modeliavimas” (2022-2025), projekto vadovas doc. Kęstutis Aidas.
2023 publikacijos
- Jegorovė, A., Xia, J., Steponaitis, M., Daskeviciene, M., Jankauskas, V., Gruodis, A., … & Nazeeruddin, M. K. (2023). Branched Fluorenylidene Derivatives with Low Ionization Potentials as Hole-Transporting Materials for Perovskite Solar Cells. Chemistry of materials, 35(15), 5914-5923 (Q1,HPC).
- Jakučionis, M., Žukas, A., & Abramavičius, D. (2023). Inspecting molecular aggregate quadratic vibronic coupling effects using squeezed coherent states. Physical Chemistry Chemical Physics, 25(3), 1705-1716 (Q2,HPC)
- Jakučionis, M., & Abramavičius, D. (2023). Thermalization of open quantum systems using the multiple-Davydov-D 2 variational approach. Physical Review A, 107(6), 062205 (Q1,HPC).
- Karpicz, R., Kareivaite, G., Macernis, M., Abramavicius, D., & Valkunas, L. (2023). Two phases of trans-stilbene in a polystyrene matrix. Physical Chemistry Chemical Physics, 25(32), 21183-21190 (Q2,HPC).
- Baliulyte, L., Abramavicius, D., Bagdonas, S., Kalnaityte, A., Poderys, V., Rotomskis, R., & Barzda, V. (2023). Comparative quantum chemical and spectral characterization of meso-tetra (4-sulfonatophenyl) porphine forms as seeds for J-and H-aggregates. AIP Advances, 13(10) (Q4,HPC).
- Maciaszek, M., Žalandauskas, V., Silkinis, R., Alkauskas, A., & Razinkovas, L. (2023). The application of the SCAN density functional to color centers in diamond. The Journal of Chemical Physics, 159(8) (Q1,HPC).
- Tamošiūnaitė, J., Streckaitė, S., Chmeliov, J., Valkunas, L., & Gelzinis, A. (2023). Concentration quenching of fluorescence in thin films of zinc-phthalocyanine. Chemical Physics, 572, 111949 (Q3,HPC).
- Juknevicius, P., Chmeliov, J., Valkunas, L., & Gelzinis, A. (2023). Application of artificial neural networks for modeling of electronic excitation dynamics in 2D lattice: Direct and inverse problems. AIP Advances, 13(3) (Q4,HPC).
- Jovaišaitė, J., Baronas, P., Jonusauskas, G., Gudeika, D., Gruodis, A., Gražulevičius, J. V., & Juršėnas, S. (2023). TICT compounds by design: comparison of two naphthalimide-π-dimethylaniline conjugates of different lengths and ground state geometries. Physical Chemistry Chemical Physics (Q1,HPC).
- Zakutauskaitė, K., Mačernis, M., Nguyen, H. H., Ogilvie, J. P., & Abramavičius, D. (2023). Extracting the excitonic Hamiltonian of a chlorophyll dimer from broadband two-dimensional electronic spectroscopy. The Journal of Chemical Physics, 158(1), 015103 (Q1,HPC).
- Jakučionis, M., Žukas, A., & Abramavičius, D. (2023). Inspecting molecular aggregate quadratic vibronic coupling effects using squeezed coherent states. Physical Chemistry Chemical Physics (Q1,HPC).
- Stocka, J., Platakyte, R., Hickman, D., Carrigan-Broda, T., Ceponkus, J., Sablinskas, V., … & Guirgis, G. A. (2023). Experimental (Raman and IR) and computational (DFT, MP2) studies of the conformational diversity of 1-chloromethyl-1-fluorosilacyclopentane molecule. Journal of Molecular Structure, 1272, 134125 (Q3,HPC).
Q1/Q2: 8
2023 projektai
- ,,Paukščių Tako galaktikos padrikųjų spiečių Persėjo vijoje dinaminės evoliucijos tyrimai“ LMT mokslininkų grupių projektas nr. P-MIP-23-262 (2023-2026). Vadovas dr. Justas Zdanavičius.
-
„Optiškai jautrių molekulių agregacijos ir spektroskopinių savybių modeliavimas“ LMT mokslininkų grupių projektas nr. S-MIP-23-48 (2023-2026) vadovas prof. Darius Abramavičius.
-
P-MIP-23-146 „Elektrocheminės degradacijos ir senėjimo procesų vandeninėje terpėje tyrimai NASICON tipo medžiagose: link in situ BMR (ELEGRANT).“ (2023-2026) vadovas dr. V. Klimavičius.
-
QuantERA grant SensExtreme; postdoctoral fellowship project „Spalvinių centrų heksagoniniame boro nitride optinių savybių teorinis tyrimas“ 09.3.3-LMT-K-712-23-0110 (2021-2023). Dr. Marek Maciaszek.
-
National Competence Centres in the framework of EuroHPC Phase 2 – EuroCC 2 (DIGITAL-EUROHPC-JU-2022-NCC-01-01), vadovas doc. Mindaugas Mačernis (VU). 2023-2026
-
“Neklasikinės sukinių būsenos labai šaltų atomų dujose”, projekto nr. 09.3.3-LMT-K-712-23-0035, Lietuvos mokslo taryba, 2021-2023.
-
LMT mokslininkų grupių projektas nr. S-MIP-22-74 “Bioaktyvių joninių skysčių struktūrinių ir BMR spektrinių parametrų modeliavimas” (2022-2025), projekto vadovas doc. Kęstutis Aidas.
2022 publikacijos
- Vindolet, B., Adam, M. P., Toraille, L., Chipaux, M., Hilberer, A., Dupuy, G., … & Roch, J. F. (2022). Optical properties of SiV and GeV color centers in nanodiamonds under hydrostatic pressures up to 180 GPa. Physical Review B, 106(21), 214109 (Q1,HPC).
- Maciaszek, M., Razinkovas, L., & Alkauskas, A. (2022). Thermodynamics of carbon point defects in hexagonal boron nitride. Physical review materials, 6(1), 014005 (Q2,HPC).
- Watanabe, A., Nakai, S., Sekiguchi, K., Deltuva, A., Goto, S., Hatanaka, K., … & Wakasa, T. (2022). Spin correlation coefficient for proton-He 3 elastic scattering at 100 MeV. Physical Review C, 106(5), 054002 (Q1,HPC).
- Klimavičius, V., Klimkevičius, V., Dagys, L., Aidas, K., Makuška, R., & Balevičius, V. (2022). Solid-state NMR study of spin dynamics and local disorder in smart polymers: PDMAEMA. Lithuanian Journal of Physics, 62(4) (Q4,HPC).
- Watanabe, A., Nakai, S., Sekiguchi, K., Deltuva, A., Goto, S., Hatanaka, K., … & Wakasa, T. (2022). Spin correlation coefficient for proton-He 3 elastic scattering at 100 MeV. Physical Review C, 106(5), 054002 (Q1,HPC).
- Jasiūnas, R., Zhang, H., Gelžinis, A., Chmeliov, J., Franckevičius, M., Gao, F., & Gulbinas, V. (2022). Interplay between charge separation and hole back transfer determines the efficiency of non-fullerene organic solar cells with low energy level offset. Organic Electronics, 108, 106601 (Q2).
- Driukas, S., Rutkauskas, D., Franckevičius, M., Chmeliov, J., & Gulbinas, V. (2022). Photoluminescence Dynamics of MAPI Perovskite Films Induced by Lateral Electric Field. physica status solidi (RRL)–Rapid Research Letters, 16(12), 2200293 (Q2).
- Vindolet, B., Adam, M. P., Toraille, L., Chipaux, M., Hilberer, A., Dupuy, G., … & Roch, J. F. (2022). Optical properties of SiV and GeV color centers in nanodiamonds under hydrostatic pressures up to 180 GPa. Physical Review B, 106(21), 214109 (Q1,HPC).
- Zakutauskaite, K., Macernis, M., Nguyen, H., Ogilvie, J. P., & Abramavicius, D. (2022). Extracting the excitonic Hamiltonian of a Chlorophyll dimer from broadband two-dimensional electronic spectroscopy. The Journal of Chemical Physics (Q1,HPC).
- Balevičius, V., Aidas, K., Maršalka, A., Kuliešius, F., Jakubkienė, V., & Tumkevičius, S. (2022). 17O NMR and DFT study of hydrogen bonding: Proton sharing and incipient transfer. Lithuanian Journal of Physics, 62(2) (Q4,HPC).
- Klimavicius, V., Maršalka, A., Kizalaite, A., Zarkov, A., Kareiva, A., Aidas, K., … & Balevicius, V. (2022). Step-by-step from amorphous phosphate to nano-structured calcium hydroxyapatite: monitoring by solid-state 1 H and 31 P NMR and spin dynamics. Physical Chemistry Chemical Physics, 24(31), 18952-18965 (Q1,HPC).
- Jakučionis, M., Žukas, A., & Abramavičius, D. (2022). Modeling molecular J and H aggregates using multiple-Davydov D2 ansatz. Physical Chemistry Chemical Physics, 24(29), 17665-17672. (Q1,HPC).
- Macernis M., Mickus V., Ahonen J.,Diska L., Franukevicius J., Sulskus J. Still Unsolved High-Performance Computing Challenges for up to Pre-Petascale Homogeneous Supercomputers (nonISI). https://arxiv.org/abs/2210.00934
- Mačernis, M., et al., Mechanism of Proton Transfer in Bacteriorhodopsin. Lithuanian Journal of Physics, 2022. 62(3): p. 127–141. (Q4, HPC).
- Mikalčiūtė, A., Gelzinis, A., Mačernis, M., Büchel, C., Robert, B., Valkunas, L., & Chmeliov, J. (2022). Structure-based model of fucoxanthin–chlorophyll protein complex: Calculations of chlorophyll electronic couplings. The Journal of Chemical Physics, 156(23), 234101 (Q1,HPC).
- Macernis, M., Streckaite, S., Litvin, R., Pascal, A. A., Llansola-Portoles, M. J., Robert, B., & Valkunas, L. (2022). Electronic and Vibrational Properties of Allene Carotenoids. The Journal of Physical Chemistry A (Q2,HPC).
- Maciaszek, M., Razinkovas, L., & Alkauskas, A. (2022). Thermodynamics of carbon point defects in hexagonal boron nitride. Physical Review Materials, 6(1), 014005 (Q2,HPC).
- Jakučionis, M., Gaižiu̅nas, I., Šulskus, J., & Abramavičius, D. (2022). Simulation of Ab Initio Optical Absorption Spectrum of β-Carotene with Fully Resolved S 0 and S 2 Vibrational Normal Modes. The Journal of Physical Chemistry A (Q2,HPC).
- Stocka, J., Platakyte, R., McFadden, T. M. C., Ceponkus, J., Aleksa, V., Hanna, A. G., … & Guirgis, G. A. (2022). Conformational diversity of 1‑chloro-1-chloromethylsilacyclohexane with experimental (Raman and IR) and computational (DFT, MP2) methods. Journal of Molecular Structure, 1249, 131644 (Q3,HPC).
- Maleckaitė, K., Narkevičius, D., Žilėnaitė, R., Dodonova-Vaitkūnienė, J., Toliautas, S., Tumkevičius, S., & Vyšniauskas, A. (2022). Give or Take: Effects of Electron-Accepting/-Withdrawing Groups in Red-Fluorescent BODIPY Molecular Rotors. Molecules, 27(1), 23 (Q2,HPC).
15: Q1/Q2
2022 projektai
- QuantERA grant SensExtreme; postdoctoral fellowship project „Spalvinių centrų heksagoniniame boro nitride optinių savybių teorinis tyrimas“ 09.3.3-LMT-K-712-23-0110 (2021-2023). Dr. Marek Maciaszek.
-
“Neklasikinės sukinių būsenos labai šaltų atomų dujose”, projekto nr. 09.3.3-LMT-K-712-23-0035, Lietuvos mokslo taryba, 2021-2023.
-
LMT mokslininkų grupių projektas nr. S-MIP-22-74 “Bioaktyvių joninių skysčių struktūrinių ir BMR spektrinių parametrų modeliavimas” (2022-2025), projekto vadovas doc. Kęstutis Aidas.
-
LMT finansuojamas Studentų mokslinės praktikos projektas nr. 09.3.3.-LMT-K-712-25-0222 “Joninių skysčių ir vandens mišinių struktūros ir BMR parametrų modeliavimas” (2021-09-01 iki 2022-03-31), projekto vadovas doc. Kęstutis Aidas.
-
„Mokslinių tyrimų, eksperimentinės plėtros ir inovacijų skatinimas“ 01.2.2-LMT-K-718 priemonės „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“ veiklą „Mokslininkų iš užsienio pritraukimas vykdyti mokslinius tyrimus“. ,,Vandeninių Na-jonų technologijų tyrimai ir taikymai energijos kaupimui (NaAquaCell)“ projektas (nuo 2018-11-05 iki 2022-11-04, vadovas doc. Linas Vilčiauskas).
-
LMT mokslininkų grupių projektas ,,Molekuliniai fotosintetinės šviesorankos ir reguliacijos mechanizmai“ (2020-2022), projekto vadovas prof. Leonas Valkūnas.
-
‘National Competence Centres in the framework of EuroHPC’ — ‘EUROCC‘ Nr. 951732 — EUROCC — H2020-JTI-EuroHPC-2019-2, vadovas doc. Mindaugas Mačernis (VU).
-
Projektas bendrai finansuotas iš Europos regioninės plėtros fondo lėšų pagal 01.2.2-LMT-K-718 priemonės veiklą „Aukšto lygio tyrėjų grupių vykdomi moksliniai tyrimai, skirti kurti ūkio sektoriams aktualias MTEP veiklų tematikas atitinkančius rezultatus, kurie vėliau galėtų būti komercinami“, ,,MAGNETO-PLAZMONINĖS NANODALELĖS BIOLOGINIŲ PAVIRŠIŲ SERS” (2020-2023), projekto vadovas prof. habil. dr. Gediminas Niaura.
-
LMT Mokslininkų grupių grupių projektas ,,Optinių sužadinimų evoliucija heterogeniniuose molekulių dariniuose” (S-MIP-20-47) (2020-2022). Projekto vadovas- prof. Darius Abramavičius.
-
“Sistemų biologijos metodai ląstelių elektroporacijai ir su ja susijusiems procesams modeliuoti ir analizuoti”, LMT sutartis Nr. S-MIP-20-29 (2020-2022), projekto vadovas prof. Gintautas Saulis.
-
Lietuvos mokslo tarybos mokslininkų grupių projektas: „Naujos kartos fluorescuojantys klampos jutikliai“, sutarties Nr. P-MIP-19-211 (2019-2022), vadovas doc. Aurimas Vyšniauskas.
-
,,Poliarimetrinė netiesinė mikroskopija biomedicininiams tyrimams ir vėžio diagnostikai“ (LMT projektas finansuojamas Europos regioninės plėtros fondo lėšomis pagal priemonės Nr. 01.2.2-LMT-K-718 veiklą „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“) (2019-2022). Projekto vadovas prof. Virginijus Barzda, bendradarbiaujama su prof. Dariumi Abramavičiumi.
-
Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje (SMART) (01.2.2-LMT-K-718) ,,Pažangių optoelektronikos medžiagų kūrimas taikant išmaniąją molekulių inžineriją” (2018-2022), projekto vadovas prof. Saulius Juršėnas.
2021 publikacijos
- Velička, M., Zacharovas, E., Adomavičiūtė, S., & Šablinskas, V. (2021). Detection of caffeine intake by means of EC-SERS spectroscopy of human saliva. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 246, 118956 (Q1,HPC).
- Voitechovič, E., Stankevičiūtė, J., Vektarienė, A., Vektaris, G., Jančienė, R., Kuisienė, N., … & Meškys, R. (2021). Bioamperometric Systems with Fructose Dehydrogenase From Gluconobacter japonicus for D‐Tagatose Monitoring. Electroanalysis, 33(6), 1393-1397 (Q2,HPC).
- Adomavičiūtė-Grabusovė, S., Ramanavičius, S., Popov, A., Šablinskas, V., Gogotsi, O., & Ramanavičius, A. (2021). Selective enhancement of SERS spectral bands of salicylic acid adsorbate on 2D Ti3C2Tx-based MXene film. Chemosensors, 9(8), 223 (Q2,HPC).
- Braver, Y., Valkunas, L., & Gelzinis, A. (2021). Stark absorption and Stark fluorescence spectroscopies: Theory and simulations. The Journal of Chemical Physics, 155(24), 244101 (Q1,HPC).
- Razinkovas, L., Doherty, M. W., Manson, N. B., Van de Walle, C. G., & Alkauskas, A. (2021). Vibrational and vibronic structure of isolated point defects: The nitrogen-vacancy center in diamond. Physical Review B, 104(4), 045303 (Q2,HPC).
- Razinkovas, L., Maciaszek, M., Reinhard, F., Doherty, M. W., & Alkauskas, A. (2021). Photoionization of negatively charged NV centers in diamond: theory and ab initio calculations. PHYSICAL REVIEW B (Q2,HPC).
- Klimavicius, V., Dagys, L., Klimkevičius, V., Lengvinaitė, D., Aidas, K., Balčiu̅nas, S., … & Balevicius, V. (2021). Solid-State NMR and Impedance Spectroscopy Study of Spin Dynamics in Proton-Conducting Polymers: An Application of Anisotropic Relaxing Model. The Journal of Physical Chemistry B, 125(45), 12592-12602 (Q3, HPC).
- Lengvinaitė, D., Kvedaraviciute, S., Bielskutė, S., Klimavicius, V., Balevicius, V., Mocci, F., … & Aidas, K. (2021). Structural Features of the [C4mim][Cl] Ionic Liquid and Its Mixtures with Water: Insight from a 1H NMR Experimental and QM/MD Study. The Journal of Physical Chemistry B, 125(48), 13255-13266 (Q3,HPC).
- Braver, Y., Valkunas, L., & Gelzinis, A. (2021). Quantum–Classical Approach for Calculations of Absorption and Fluorescence: Principles and Applications. Journal of Chemical Theory and Computation, 17(11), 7157-7168 (Q1, HPC).
- Chmeliov, J., Elkhouly, K., Gegevičius, R., Jonušis, L., Devižis, A., Gelžinis, A., … & Gulbinas, V. (2021). Ion Motion Determines Multiphase Performance Dynamics of Perovskite LEDs. Advanced Optical Materials, 2101560 (Q1).
- Razinkovas, L., Maciaszek, M., Reinhard, F., Doherty, M. W., & Alkauskas, A. (2021). Photoionization of negatively charged NV centers in diamond: theory and ab initio calculations. arXiv preprint arXiv:2104.09144 (Q2,HPC).
- Snarskis, G., Pilipavičius, J., Gryaznov, D., Mikoliu̅naitė, L., & Vilčiauskas, L. (2021). Peculiarities of Phase Formation in Mn-Based Na SuperIonic Conductor (NaSICon) Systems: The Case of Na1+ 2 x Mn x Ti2–x (PO4) 3 (0.0≤ x≤ 1.5). Chemistry of Materials, 33(21), 8394-8403 (Q1,HPC).
- Mikalčiūtė, A., & Vilčiauskas, L. (2021). Insights into the hydrogen bond network topology of phosphoric acid and water systems. Physical Chemistry Chemical Physics, 23(10), 6213-6224 (Q1,HPC).
- Weber, M., Striaukas, J., Schumacher, M., & Binder, H. (2021). Regularized regression when covariates are linked on a network: the 3CoSE algorithm. Journal of Applied Statistics, 1-20 (Q3,HPC).
- Stocka, J., Platakyte, R., McFadden, T. M. C., Ceponkus, J., Aleksa, V., Hanna, A. G., … & Guirgis, G. A. (2021). Conformational diversity of 1-chloro-1-chloromethylsilacyclohexane with experimental (Raman and IR) and computational (DFT, MP2) methods. Journal of Molecular Structure, 131644 (Q3, HPC).
- Maleckaite, K., Dodonova, J., Toliautas, S., Zilenaite, R., Jurgutis, D., Karabanovas, V., … & Vysniauskas, A. (2021). Designing a Red‐Emitting Viscosity Sensitive BODIPY Fluorophore for Intracellular Viscosity Imaging. Chemistry–A European Journal (Q2, HPC).
- Vaitukaityte, D., Momblona, C., Rakstys, K., Sutanto, A. A., Ding, B., Igci, C., … & Nazeeruddin, M. K. (2021). Cut from the same cloth: enamine-derived spirobifluorenes as hole transporters for Perovskite solar cells. Chemistry of materials, 33(15), 6059-6067 (Q1, HPC).
- Daskeviciute, S., Momblona, C., Rakstys, K., Sutanto, A. A., Daskeviciene, M., Jankauskas, V., …Gruodis,A. & Nazeeruddin, M. K. (2021). Fluorene-based enamines as low-cost and dopant-free hole transporting materials for high performance and stable perovskite solar cells. Journal of Materials Chemistry A, 9(1), 301-309.DOI 10.1039/d0ta08452b (Q1,HPC).
- Gaigalas, G., Rynkun, P., Radžiūtė, L., Jönsson, P., & Wang, K. (2021). Energy and transition data computations for P-like ions: As, Kr, Sr, Zr, Mo, and W. Atomic Data and Nuclear Data Tables, 141, 101428. Doi: 10.1016/j.adt.2021.101428 (Q2,HPC).
- Gelzinis, A., Augulis, R., Büchel, C., Robert, B., & Valkunas, L. (2021). Confronting FCP structure with ultrafast spectroscopy data: evidence for structural variations. Physical Chemistry Chemical Physics, 23(2), 806-821. DOI:10.1039/d0cp05578f (Q1).
- Fakharuddin, A., Franckevičius, M., Devižis, A., Gelžinis, A., Chmeliov, J., Heremans, P., & Gulbinas, V. (2021). Double charge transfer dominates in carrier localization in low bandgap sites of heterogeneous lead halide perovskites. Advanced Functional Materials, 31(15), 2010076 DOI:10.1002/adfm.202010076 (Q1).
- Tutkus, M., Chmeliov, J., Trinkunas, G., Akhtar, P., Lambrev, P. H., & Valkunas, L. (2021). Aggregation-related quenching of LHCII fluorescence in liposomes revealed by single-molecule spectroscopy. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 218, 112174. DOI:10.1016/j.jphotobiol.2021.112174 (Q1).
- Devižis, A., Gelzinis, A., Chmeliov, J., Diethelm, M., Endriukaitis, L., Padula, D., & Hany, R. (2021). Carrier Tunneling from Charge Transfer States in Organic Photovoltaic Cells. Advanced Functional Materials, 2102000.DOI:10.1002/adfm.202102000 (Q1).
- Daskeviciute, S., Momblona, C., Rakstys, K., Sutanto, A. A., Daskeviciene, M., Jankauskas, V., Gruodis, A., Bubniene, G., Getautis, V. & Nazeeruddin, M. K. (2021). Fluorene-based enamines as low-cost and dopant-free hole transporting materials for high performance and stable perovskite solar cells. Journal of Materials Chemistry A, 9(1), 301-309.DOI:10.1039/d0ta08452b (Q1,HPC).
- Razinkovas, L., Doherty, M. W., Manson, N. B., Van de Walle, C. G., & Alkauskas, A. (2021). Vibrational and vibronic structure of isolated point defects: the nitrogen-vacancy center in diamond. DOI:10.1103/PhysRevB.104.045303 (Q2,HPC).
- Macernis, M., Bockuviene, A., Gruskiene, R., Krivorotova, T., & Sereikaite, J. (2021). Raman study for β-ring positioning in β-Carotene complexes with Cyclodextrins and Chitooligosaccharides. Journal of Molecular Structure, 1226, 129362 (Q3,HPC).
- Karpicz, R., Ostapenko, N., Ostapenko, Y., Polupan, Y., Lazarev, I., Galunov, N., … & Valkunas, L. (2021). Unusual temperature dependence of the fluorescence decay in heterostructured stilbene. Physical Chemistry Chemical Physics, 23(5), 3447-3454. DOI: 10.1039/d0cp05436d (Q1,HPC).
- Jakučionis, M., & Abramavičius, D. (2021). Temperature-controlled open-quantum-system dynamics using a time-dependent variational method. Physical Review A, 103(3), 032202. DOI:10.1103/PhysRevA.103.032202 (Q2,HPC).
- Bubilaitis, V., Rancova, O., & Abramavicius, D. (2021). Vibration-mediated energy transport in bacterial reaction center: Simulation study. The Journal of Chemical Physics, 154(21), 214115 (Q1,HPC).
2021 projektai
- QuantERA grant SensExtreme; postdoctoral fellowship project „Spalvinių centrų heksagoniniame boro nitride optinių savybių teorinis tyrimas“ 09.3.3-LMT-K-712-23-0110 (2021-2023). Dr. Marek Maciaszek.
-
“Neklasikinės sukinių būsenos labai šaltų atomų dujose”, projekto nr. 09.3.3-LMT-K-712-23-0035, Lietuvos mokslo taryba, 2021-2023.
-
LMT finansuojamas Studentų mokslinės praktikos projektas nr. 09.3.3.-LMT-K-712-25-0222 “Joninių skysčių ir vandens mišinių struktūros ir BMR parametrų modeliavimas” (2021-09-01 iki 2022-03-31), projekto vadovas doc. Kęstutis Aidas.
-
„Mokslinių tyrimų, eksperimentinės plėtros ir inovacijų skatinimas“ 01.2.2-LMT-K-718 priemonės „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“ veiklą „Mokslininkų iš užsienio pritraukimas vykdyti mokslinius tyrimus“. ,,Vandeninių Na-jonų technologijų tyrimai ir taikymai energijos kaupimui (NaAquaCell)“ projektas (nuo 2018-11-05 iki 2022-11-04, vadovas doc. Linas Vilčiauskas).
-
Europos Sąjungos fondų investicijų veiksmų programos 9 prioriteto „Visuomenės švietimas ir žmogiškųjų išteklių potencialo didinimas“ 09.3.3-LMT-K-712 priemonės „Mokslininkų, kitų tyrėjų, studentų mokslinės kompetencijos ugdymas per praktinę mokslinę veiklą“ veiklos „Studentų gebėjimų vykdyti MTEP veiklą ugdymas“ poveiklė „Studentų gebėjimų ugdymas dalyvaujant mokslinėse vasaros praktikose. ,,Katijonų dinamikos dimetilamonio cinko-formiato [(CH3)2NH2][Zn(HCOO)3] (DMAZn) metalo-organiniame karkase tyrimas molekulių dinamikos metodais“ projektas (2021 07 05 – 2021 08 31, vadovas doc. Linas Vilčiauskas).
-
LMT mokslininkų grupių projektas ,,Molekuliniai fotosintetinės šviesorankos ir reguliacijos mechanizmai“ (2020-2022), projekto vadovas prof. Leonas Valkūnas.
-
‘National Competence Centres in the framework of EuroHPC’ — ‘EUROCC‘ Nr. 951732 — EUROCC — H2020-JTI-EuroHPC-2019-2, vadovas doc. Mindaugas Mačernis (VU).
-
Projektas bendrai finansuotas iš Europos regioninės plėtros fondo lėšų pagal 01.2.2-LMT-K-718 priemonės veiklą „Aukšto lygio tyrėjų grupių vykdomi moksliniai tyrimai, skirti kurti ūkio sektoriams aktualias MTEP veiklų tematikas atitinkančius rezultatus, kurie vėliau galėtų būti komercinami“, ,,MAGNETO-PLAZMONINĖS NANODALELĖS BIOLOGINIŲ PAVIRŠIŲ SERS” (2020-2023), projekto vadovas prof. habil. dr. Gediminas Niaura.
-
LMT Mokslininkų grupių grupių projektas ,,Optinių sužadinimų evoliucija heterogeniniuose molekulių dariniuose” (S-MIP-20-47) (2020-2022). Projekto vadovas- prof. Darius Abramavičius.
-
“Sistemų biologijos metodai ląstelių elektroporacijai ir su ja susijusiems procesams modeliuoti ir analizuoti”, LMT sutartis Nr. S-MIP-20-29 (2020-2022), projekto vadovas prof. Gintautas Saulis.
-
Lietuvos mokslo tarybos mokslininkų grupių projektas: „Naujos kartos fluorescuojantys klampos jutikliai“, sutarties Nr. P-MIP-19-211 (2019-2022), vadovas doc. Aurimas Vyšniauskas.
-
,,Poliarimetrinė netiesinė mikroskopija biomedicininiams tyrimams ir vėžio diagnostikai“ (LMT projektas finansuojamas Europos regioninės plėtros fondo lėšomis pagal priemonės Nr. 01.2.2-LMT-K-718 veiklą „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“) (2019-2022). Projekto vadovas prof. Virginijus Barzda, bendradarbiaujama su prof. Dariumi Abramavičiumi.
-
Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje (SMART) (01.2.2-LMT-K-718) ,,Pažangių optoelektronikos medžiagų kūrimas taikant išmaniąją molekulių inžineriją” (2018-2022), projekto vadovas prof. Saulius Juršėnas.
-
LMT Bendri Lietuvos Japonijos projektai LJB-3/2015 „ORGANINIO LAZERINIO TRANZISTORIAUS SUKŪRIMO LINKME“ (2015-2017-2021), projekto vadovas prof. Saulius Juršėnas.
2020 publikacijos
- Voitechovič, E., Vektarienė, A., Vektaris, G., Jančienė, R., Razumienė, J., & Gurevičienė, V. (2020). 1,4‐Benzoquinone Derivatives for Enhanced Bioelectrocatalysis by Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter Japonicus: Towards Promising D‐Fructose Biosensor Development. Electroanalysis, 32(5), 1005-1016 (Q2,HPC).
- Skuja, L., Smits, K., Trukhin, A., Gahbauer, F., Ferber, R., Auzinsh, M., … & Alkauskas, A. (2020). Dynamics of Singlet Oxygen Molecule Trapped in Silica Glass Studied by Luminescence Polarization Anisotropy and Density Functional Theory. The Journal of Physical Chemistry C, 124(13), 7244-7253 (Q2).
- Szeremeta, A. Z., Nowok, A., Sieradzki, A., Simenas, M., Vilčiauskas, L., Gągor, A., … & Pawlus, S. (2020). Relaxing under pressure with a rigid niccolite formate framework. Journal of Materials Chemistry C, 8(47), 16736-16741 (Q1).
- Gryaznov, D., Stauffer, S. K., Kotomin, E. A., & Vilčiauskas, L. (2020). Hybrid density functional theoretical study of NASICON-type Na x Ti 2 (PO 4) 3 (x= 1–4). Physical Chemistry Chemical Physics, 22(21), 11861-11870 (Q1,HPC)
- van Amerongen, H., & Chmeliov, J. (2020). Instantaneous switching between different modes of non-photochemical quenching in plants. Consequences for increasing biomass production. Biochimica et biophysica acta (BBA)-Bioenergetics, 1861(4), 148119.DOI: 10.1016/j.bbabio.2019.148119 (Q2).
- Rakstys, K., Paek, S., Drevilkauskaite, A., Kanda, H., Daskeviciute, S., Shibayama, N., Daskeviciene, M., Gruodis, A., Kamarauskas, E., Jankauskas, V. and Getautis, V. & Nazeeruddin, M. K. (2020). Carbazole-terminated isomeric hole-transporting materials for perovskite solar cells. ACS applied materials & interfaces, 12(17), 19710-19717. DOI:10.1021/acsami.9b23495 (Q1,HPC).
- Jasiūnas, R., Zhang, H., Yuan, J., Zhou, X., Qian, D., Zou, Y., Devižis, A., Sulskus, J., Gao, F. & Gulbinas, V. (2020). From Generation to Extraction: A Time-Resolved Investigation of Photophysical Processes in Non-fullerene Organic Solar Cells. The Journal of Physical Chemistry C, 124(39), 21283-21292. DOI:10.1021/acs.jpcc.0c05263 (Q2).
- Braver, Y., Valkunas, L., & Gelzinis, A. (2020). Benchmarking the forward–backward trajectory solution of the quantum-classical Liouville equation. The Journal of Chemical Physics, 152(21), DOI: 214116.10. 1063/5.0006538 (Q1,HPC).
- Radžiūtė, L., Gaigalas, G., Kato, D., Rynkun, P., & Tanaka, M. (2020). Extended Calculations of Energy Levels and Transition Rates for Singly Ionized Lanthanide Elements. I. Pr–Gd. The Astrophysical Journal Supplement Series, 248(1), 17.DOI: 10.3847/1538-4365/ab8312 (Q1, HPC).
- Gaigalas, G., Rynkun, P., Radžiūtė, L., Kato, D., Tanaka, M., & Jönsson, P. (2020). Energy Level Structure and Transition Data of Er2+. The Astrophysical Journal Supplement Series, 248(1), 13. DOI:10.3847/1538-4365/ab881a (Q1,HPC).
- Rynkun, P., Gaigalas, G., & Jönsson, P. (2020). Theoretical studies of energy levels and transition data for Zr III. Astronomy & Astrophysics, 637, A10.DOI:10.1051/0004-6361/201937243 (Q1,HPC).
- McFadden, T. M. C., Platakyte, R., Stocka, J., Ceponkus, J., Aleksa, V., Carrigan-Broda, T., … & Guirgis, G. A. (2020). Experimental (Raman and IR) and computational (DFT, MP2) studies of conformational diversity of 1-chloromethyl-1-fluorosilacyclohexane. Journal of Molecular Structure, 1221, 128786. DOI:10.1016/j.molstruc.2020.128786 (Q3,HPC).
- Stocka, J., Čeponkus, J., Šablinskas, V., & Rodziewicz, P. (2020). Conformational diversity of the THF molecule in N2 matrix by means of FTIR matrix isolation experiment and Car-Parrinello molecular dynamics simulations. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 238, 118425. DOI:org/10.1016/j.saa.2020.118425 (Q1).
- Lengvinaitė, D., Klimavicius, V., Balevicius, V., & Aidas, K. (2020). Computational NMR Study of Ion Pairing of 1-Decyl-3-methyl-imidazolium Chloride in Molecular Solvents. The Journal of Physical Chemistry B, 124(47), 10776-10786. DOI:10.1021/acs.jpcb.0c07450 (Q3,HPC).
- Dementjev, A., Rutkauskas, D., Polovy, I., Macernis, M., Abramavicius, D., Valkunas, L., & Dovbeshko, G. (2020). Characterization of thymine microcrystals by CARS and SHG microscopy. Scientific reports, 10(1), 1-9.DOI:10.1038/s41598-020-74305-4 (Q1,HPC).
- Jakučionis, M., Mancal, T., & Abramavičius, D. (2020). Modeling irreversible molecular internal conversion using the time-dependent variational approach with sD 2 ansatz. Physical Chemistry Chemical Physics, 22(16), 8952-8962.DOI:10.1039/d0cp01092h (Q1,HPC).
- Mascoli, V., Gelzinis, A., Chmeliov, J., Valkunas, L., & Croce, R. (2020). Light-harvesting complexes access analogue emissive states in different environments. Chemical science, 11(22), 5697-5709. DOI:5709.10.1039/d0sc00781a (Q1,HPC).
- Šimėnas, M., Klose, D., Ptak, M., Aidas, K., Mączka, M., Banys, J., … & Jeschke, G. (2020). Magnetic excitation and readout of methyl group tunnel coherence. Science advances, 6(18), eaba1517. DOI:10.1126/sciadv.aba1517 (Q1, HPC)
- Cedillo, A., Kvedaravičiūtė, S., & Aidas, K. (2020). Prediction of the tautomer stability and acidity of phenacylpyridines in aqueous solution. Theoretical Chemistry Accounts, 139(3), 1-11.DOI:10.1007/s00214-020-2558-3 (Q4, HPC).
- Dagys, L., Klimkevičius, V., Klimavicius, V., Aidas, K., Makuška, R., & Balevicius, V. (2020). CP MAS kinetics in soft matter: Spin diffusion, local disorder and thermal equilibration in poly (2-hydroxyethyl methacrylate). Solid state nuclear magnetic resonance, 105, 101641.DOI:10.1016/j.ssnmr.2019.101641 (Q2,HPC).
- Polita, A., Toliautas, S., Žvirblis, R., & Vyšniauskas, A. (2020). The effect of solvent polarity and macromolecular crowding on the viscosity sensitivity of a molecular rotor BODIPY-C 10. Physical Chemistry Chemical Physics, 22(16), 8296-8303. DOI:10.1039/c9cp06865a (Q1,HPC).
- Gelzinis, A., & Valkunas, L. (2020). Analytical derivation of equilibrium state for open quantum system. The Journal of chemical physics, 152(5), 051103.DOI:10.1063/1.5141519 (Q1,HPC)
- Streckaite, S., Macernis, M., Li, F., Kuthanová Trsková, E., Litvin, R., Yang, C., … & Llansola-Portoles, M. J. (2020). Modeling Dynamic Conformations of Organic Molecules: Alkyne Carotenoids in Solution. The Journal of Physical Chemistry A, 124(14), 2792-2801. DOI:10.1021/acs.jpca.9b11536 (Q2,HPC)
2020 projektai
- „Mokslinių tyrimų, eksperimentinės plėtros ir inovacijų skatinimas“ 01.2.2-LMT-K-718 priemonės „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“ veiklą „Mokslininkų iš užsienio pritraukimas vykdyti mokslinius tyrimus“. ,,Vandeninių Na-jonų technologijų tyrimai ir taikymai energijos kaupimui (NaAquaCell)“ projektas (nuo 2018-11-05 iki 2022-11-04, vadovas doc. Linas Vilčiauskas).
-
Europos Sąjungos fondų investicijų veiksmų programos 9 prioriteto „Visuomenės švietimas ir žmogiškųjų išteklių potencialo didinimas“ 09.3.3-LMT-K-712 priemonės „Mokslininkų, kitų tyrėjų, studentų mokslinės kompetencijos ugdymas per praktinę mokslinę veiklą“ veiklos „Studentų gebėjimų vykdyti MTEP veiklą ugdymas“ poveiklė „Studentų gebėjimų ugdymas dalyvaujant mokslinėse vasaros praktikose“ ,,Na-Mn-Ti-PO4 sistemos fazinės diagramos analizė naudojantis pirminių principų skaičiavimais“ projektas (2019 10 11 – 2020 04 30, vadovas doc. Linas Vilčiauskas).
-
LMT mokslininkų grupių projektas ,,Molekuliniai fotosintetinės šviesorankos ir reguliacijos mechanizmai“ (2020-2022), projekto vadovas prof. Leonas Valkūnas.
-
‘National Competence Centres in the framework of EuroHPC’ — ‘EUROCC‘ Nr. 951732 — EUROCC — H2020-JTI-EuroHPC-2019-2, vadovas doc. Mindaugas Mačernis (VU).
-
Projektas bendrai finansuotas iš Europos regioninės plėtros fondo lėšų pagal 01.2.2-LMT-K-718 priemonės veiklą „Aukšto lygio tyrėjų grupių vykdomi moksliniai tyrimai, skirti kurti ūkio sektoriams aktualias MTEP veiklų tematikas atitinkančius rezultatus, kurie vėliau galėtų būti komercinami“, ,,MAGNETO-PLAZMONINĖS NANODALELĖS BIOLOGINIŲ PAVIRŠIŲ SERS” (2020-2023), projekto vadovas prof. habil. dr. Gediminas Niaura.
-
LMT Mokslininkų grupių grupių projektas ,,Optinių sužadinimų evoliucija heterogeniniuose molekulių dariniuose” (S-MIP-20-47) (2020-2022). Projekto vadovas- prof. Darius Abramavičius.
-
“Sistemų biologijos metodai ląstelių elektroporacijai ir su ja susijusiems procesams modeliuoti ir analizuoti”, LMT sutartis Nr. S-MIP-20-29 (2020-2022), projekto vadovas prof. Gintautas Saulis.
-
Lietuvos mokslo tarybos mokslininkų grupių projektas: „Naujos kartos fluorescuojantys klampos jutikliai“, sutarties Nr. P-MIP-19-211 (2019-2022), vadovas doc. Aurimas Vyšniauskas.
-
,,Poliarimetrinė netiesinė mikroskopija biomedicininiams tyrimams ir vėžio diagnostikai“ (LMT projektas finansuojamas Europos regioninės plėtros fondo lėšomis pagal priemonės Nr. 01.2.2-LMT-K-718 veiklą „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“) (2019-2022). Projekto vadovas prof. Virginijus Barzda, bendradarbiaujama su prof. Dariumi Abramavičiumi.
-
Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje (SMART) (01.2.2-LMT-K-718) ,,Pažangių optoelektronikos medžiagų kūrimas taikant išmaniąją molekulių inžineriją” (2018-2022), projekto vadovas prof. Saulius Juršėnas.
-
LMT mokslininkų grupių projektas „BMR kvadrupolinės relaksacijos teorinių modelių vystymas ir taikymai“, S-MIP-17-84 (2017-2020), projekto vadovas doc. Kęstutis Aidas.
-
LMT Bendri Lietuvos Japonijos projektai LJB-3/2015 „ORGANINIO LAZERINIO TRANZISTORIAUS SUKŪRIMO LINKME“ (2015-2017-2021), projekto vadovas prof. Saulius Juršėnas.
2019 publikacijos
- Voitechovič, E., Jančienė, R., Mikulskienė, G., Vektarienė, A., Vektaris, G., & Razumienė, J. (2019). Synthesis and DFT characterisation of 2-arylamino-1, 4-benzoquinone derivatives as potential electron transfer mediators. Chemija, 30(2) (Q4,HPC).
- S.S. Bystrov, V.V. Matveev, A.V. Egorov, Y.S. Chernyshev, V.A. Konovalov, V.Balevicius, V.I. Chizhik.
Translational Diffusion in a Set of Imidazolium-Based Ionic Liquids [bmim]+A− and Their Mixtures with Water.J. Phys. Chem. B 123 (2019), 9187. - Matas Tartėnas, Kastytis Zubovas, Feeding of active galactic nuclei by dynamical perturbations, Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, Volume 492, Issue 1, February 2020, Pages 603–614, https://doi.org/10.1093/mnras/stz3484
- Mackoit-Sinkevičienė, M.; Maciaszek, M.; Van de Walle, C. G.; Alkauskas, A., Carbon dimer defect as a source of the 4.1 eV luminescence in hexagonal boron nitride. App. Phys. Lett. 2019, 115 (21), 212101.
- J. Koncevičiūtė, S. Kučas, A. Kynienė, Š. Masys, V. Jonauskas, Electron-impact double and triple ionization of Se3+, J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys.52, 025203 (2019). DOI: 10.1088/1361-6455/aacd87
- Stepas Toliautas, Jelena Dodonova, Audrius Žvirblis, Ignas Čiplys, Artūras Polita, Andrius Devižis, Sigitas Tumkevičius, Juozas Šulskus, and Aurimas Vyšniauskas, Enhancing the Viscosity-Sensitive Range of a BODIPY Molecular Rotor by Two Orders of Magnitude, Chem. Eur. J. 2019, 25, 10342 – 10349, DOI: 10.1002/chem.201901315
- Tomas Serevičius, Rokas Skaisgiris, Jelena Dodonova, Laimis Jagintavičius, Jonas Bucevičius, Karolis Kazlauskas, Saulius Juršėnas and Sigitas Tumkevičius, Emission wavelength dependence on the rISC ratein TADF compounds with large conformational disorder, Chem. Commun., 2019,55, 1975-1978 DOI: 10.1039/c8cc08906j
- Aušra Kynienė, Sigitas Kučas, Šarūnas Masys, and Valdas Jonauskas Electron-impact ionization of Fe8+ Astronomy and Astrophysics 624, A14 (2019) https://doi.org/10.1051/0004-6361/201833762
- Rasa Platakyte, Alejandro Gutiérrez-Quintanilla, Valdas Sablinskas, and Justinas Ceponkus, Influence of environment and association with water, to internal structure of trifluoroacetylacetone. Matrix isolation FTIR study Low Temperature Physics/Fizika Nizkikh Temperatur, 2019, v. 45, No. 6 , pp. 722–735
- Rima Kriauzienė, Andrej Bugajev, Raimondas Čiegis A Three-Level Parallelisation Scheme and Application to the Nelder-Mead Algorithm https://arxiv.org/abs/1904.05208
- Dovile ̇Lengvinaitė, Kęstutis Aidas and Liudvikas Kimtys, Molecular aggregation in liquid acetic acid: insightfrom molecular dynamics/quantum mechanicsmodelling of structural and NMR properties ,Phys.Chem.Chem.Phys.,2019,21,14811 DOI: 10.1039/c9cp01892a
- Raimondas Čiegis, Remigijus Čiegis, Numerical algorithms for solving the optimalcontrol problem of simple bioreactors Nonlinear Analysis: Modelling and Control, Vol. 24, No. 4, 626–638 https://doi.org/10.15388/NA.2019.4.8
- Edita Voitechovič, Regina Jančienė, Gema Mikulskienė, Aušra Vektarienė, Gytis Vektaris, Julija Razumienė, Synthesis and DFT characterisation of 2-arylamino-1,4-benzoquinone derivatives as potential electron transfer mediators CHEMIJA. 2019. Vol. 30. No. 2. P. 115–126
- Shalva Amiranashvili, Mindaugas Radziunas, Uwe Bandelow,Raimondas Čiegis, Numerical methods for accurate description of ultrashort pulses in optical fibers Commun Nonlinear Sci Numer Simulat 67 (2019) 391–402, https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2018.07.031
- Augustinas Stepšys, Saulius Mickevičius, Darius Germanas, Ramutis Kazys Kalinauskas Calculation of orbital fractional parentage coefficients for five particles in translationally invariant basis Computer Physics Communications, 236, 26-33, 2019
2018 publikacijos
- Andrius Gelzinis, Jevgenij Chmeliov, Alexander V. Ruban, Leonas Valkunas, Can red-emitting state be responsible for fluorescence quenching in LHCII aggregates? Photosynth Res (2018) 135:275–284 DOI: 10.1007/s11120-017-0430-7
- Maryte Daskeviciene, Simona Urnikaite, Greta Planciunaite , Tadas Malinauskas, Alytis Gruodis, Mindaugas Viliunas, Egidijus Kamarauskas, Valentas Gaidelis, Vygintas Jankauskas, Vytautas Getautisa, An air-stable and solution processable tetracarboxydiimide-based materials with tunable charge transport properties, Dyes and Pigments 158 (2018) 157–164 ,https://doi.org/10.1016/j.dyepig.2018.05.041
- Augustinas Stepšys, Saulius Mickevičius, Darius Germanas, Ramutis Kazys Kalinauskas Caculating fractional parentage coefficients for six body system in translational invariant basis, Physics of Atomic Nuclei, 2018 (Vol. 81, Nr. 6)
- G. Gaigalas, D. Kato, P. Rynkun, L. Radžiūtė, and M. Tanaka Extended calculations of energy levels and transition rates of Nd II-IV ions for application to neutron star mergers. The Astrophysical Journal Supplement Series (2018)
- Austėja Bukauskytė Renata Karpicz Romualdas Striela Linas Labanauskas Alytis Gruodis Domantas Peckus Ramūnas Augulis Vidmantas Gulbinas The influence of substituents of perylenediimides on their spectroscopic properties Journal of Luminescence Volume 195, March 2018, Pages 252-258 DOI: https://doi.org/10.1016/j.jlumin.2017.11.023
- Justinas Čeponkus, Rasa Platakytė, Valdas Šablinskas, Alejandro Gutierrez Quintanilla FTIR study of acetylacetone, D2-acetylacetone and hexafluoroacetylacetone–water complexes in argon and nitrogen matrices CHEMIJA. 2018. vol. 29. No. 1. P. 1–16 DOI: https://doi.org/10.6001/chemija.v29i1.3639
- Artiom Magomedov, Sanghyun Paek, Paul Gratia, Ernestas Kasparavicius, Maryte Daskeviciene, Egidijus Kamarauskas, Alytis Gruodis, Vygintas Jankauskas, Kristina Kantminiene, Kyung Taek Cho, Kasparas Rakstys, Tadas Malinauskas, Vytautas Getautis and Mohammad Khaja Nazeeruddin Diphenylamine-Substituted Carbazole-Based Hole Transporting Materials for Perovskite Solar Cells: Influence of Isomeric Derivatives Adv. Funct. Mater.2018, 1704351(1-13) DOI: 10.1002/adfm.201704351
- A Kynienė, G Merkelis, A Šukys, Š Masys, S Pakalka, R Kisielius and V. Jonauskas Maxwellian rate coefficients for electron-impact ionization of W 26+ Journal of Physics B: Atomic, Molecular and Optical Physics, Volume 51, Number 15 2018 DOI: https://doi.org/10.1088/1361-6455/aacd87
- Jurgita Koncevičiūtė, Sigitas Kučas, Šarūnas Masys, Aušra Kynienė, and Valdas Jonauskas Electron-impact triple ionization of Se2+ Phys. Rev. A 97, 012705 2018 DOI: https://doi.org/10.1088/0953-4075/47/13/135203
- S. Pakalka, S. Kučas, Š. Masys, A. Kynienė, A. Momkauskaitė, and V. Jonauskas Electron- impact single ionization of the Se3+ ion Phys. Rev. A 97, 012708 2018 DOI:https://doi.org/10.1103/PhysRevA.97.012708
- L. Weston, D. Wickramaratne, M. Mackoit, A. Alkauskas, and C. G. Van de Walle Native point defects and impurities in hexagonal boron nitride Phys. Rev. B 97, 214104 DOI:https://doi.org/ 10.1103/PhysRevB.97.214104
- Elisa Londero, Gergő Thiering, Lukas Razinkovas, Adam Gali, and Audrius Alkauskas Vibrational modes of negatively charged silicon-vacancy centers in diamond from ab initio calculations Phys. Rev. B 98, 035306 DOI:https://doi.org/10.1103/PhysRevB.98.035306
- Masaomi Tanaka, Daiji Kato, Gediminas Gaigalas, Pavel Rynkun, Laima Radžiūtė, Shinya Wanajo, Yuichiro Sekiguchi, Nobuyuki Nakamura, Hajime Tanuma, Izumi Murakami and Hiroyuki A. SakaueProperties of Kilonovae from Dynamical and Post-merger Ejecta of Neutron Star Mergers The Astrophysical Journal(2018), Volume 852, Number 2 https://doi.org/10.3847/1538-4357/aaa0cb
- A. Vektarienė,G. Vektaris. A theoretical study of styrene and sulfenyl chloride reaction mechanism CHEMIJA. 2018. Vol. 29. No. 3. P. 166–174 DOI: https://doi.org/10.6001/chemija.v29i3.3819
- A. Vektarienė. Bonding Nature of Cyclometalated Ru Complex: How DFT Study Revealing the Dewar-Chatt-Duncanson Model Relates to the Molecular Properties. ChemistrySelect 2018 vol 3, 38 DOI: https://doi.org/10.1002/slct.201802330
- A. Vektarienė. The Transition Metal to Ligand Bonding Nature:a Quantum Chemical Study of p-Allyl-ruthenacycle. Lith. J. Phys. 58, 232–245 (2018) DOI: 10.3952/physics.v58i3.3811
- M. Šimėnas, A. Ciupa, G. Usevičius, K. Aidas, D. Klose, G. Jeschke, M. Mączka, G.Völkel, A. Pöppl, J. Banys.Electron paramagnetic resonance of copper doped[(CH3)2NH2][Zn(HCOO)3] hybrid perovskite framework. Phys. Chem. Chem. Phys., 2018,20, 12097-12105 DOI: 10.1039/C8CP01426D
- K. Kristinaitytė, A. Maršalka, L. Dagys, K. Aidas, I. Doroshenko, Y. Vaskivskyi, Y.Chernolevska, V. Pogorelov, N.R. Valevičienė, V. Balevicius. NMR, Raman and DFTStudy of Lyotropic Chromonic Liquid Crystals of Biomedical Interest: TautomericEquilibrium and Slow Self-Assembling in Sunset Yellow Aqueous Solutions. J. Phys. Chem. B, 2018, 122 (12), 3047–3055 DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b00350
- M. Šimėnas, L. Macalik, K. Aidas, V. Kalendra, D. Klose, G. Jeschke, M. Mączka, G.Völkel, J. Banys, A. Pöppl. Pulse EPR and ENDOR Study of Manganese Doped[(CH3)2NH2] [Zn(HCOO)3] Hybrid Perovskite Framework. J. Phys. Chem. C, 2017, 121 (48), 27225– 27232 DOI: 10.1021/acs.jpcc.7b09990
2017 publikacijos
- Macernis M On the Dimers Stability of Allicin and Its Derivatives Interacting with AT, GC, and DNA Bridge: DFT Study J. Chem., 2017, vol. 2017, 1428508, 11 pages (https://doi.org/10.1155/2017/1428508) 2017
- Velicka M, Pucetaite M, Urboniene V, Ceponkus J, Jankevicius F, Sablinskas V. Detection of cancerous kidney tissue by means of SERS spectroscopy of extracellular fluid. J Raman Spectrosc. 2017;1–11. https://doi.org/10.1002/jrs.5232
- A Gelzinis, D Abramavicius, JP Ogilvie, L Valkunas: Spectroscopic properties of photosystem II reaction center revisited
10.1063/1.4997527. The Journal of Chemical Physics 147 (2017) 115102. - A Gelzinis, J Chmeliov, AV Ruban, L Valkunas: Can red-emitting state be responsible for fluorescence quenching in LHCII aggregates? Photosynthesis Research (2017).
- T. B. Biktagirov, A. N. Smirnov, V. Yu. Davydov, M. W. Doherty, A. Alkauskas, B. C. Gibson, and V. A. Soltamov
Phys. Rev. B 96, 075205 – Published 18 August 2017
https://journals.aps.org/prb/abstract/10.1103/PhysRevB.96.075205 - D. Germanas, A. Stepšys, S. Mickevičius, R.K. Kalinauskas, HOTB update: Parallel code for calculation of three- and four-particle harmonic oscillator transformation brackets and their matrices using OpenMP, In Computer Physics Communications, Volume 215, 2017, Pages 259-264, ISSN 0010-4655, https://doi.org/10.1016/j.cpc.2017.01.028.
(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010465517300401)
Keywords: Mathematical methods in physics; Algebraic methods; Nuclear shell model - Ciegi, Raimondas; Staricovicius, Vadimas; Margenov, Svetozar On Parallel Numerical Algorithms for Fractional Diffusion Problems
URI: http://hdl.handle.net/10016/24219
2016 publikacijos
- Paulius Baronas, Karolis Kazlauskas, Alytis Gruodis, Vygintas Jankauskas, Ausra Tomkeviciene, Jurate Simokaitiene, Juozas Vidas Grazulevicius, Saulius Jursenas, High-triplet-energy carbazole and fluorene tetrads, In Journal of Luminescence, Volume 169, Part A, 2016, Pages 256-265, ISSN 0022-2313, https://doi.org/10.1016/j.jlumin.2015.08.019.
(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022231315300375) - Kipras Redeckas, Stepas Toliautas, Rasa Steponavičiūtė, Algirdas Šačkus, Juozas Sulskus, Mikas Vengris, A femtosecond stimulated Raman spectroscopic study on the oxazine ring opening dynamics of structurally-modified indolobenzoxazines, In Chemical Physics Letters, Volume 653, 2016, Pages 67-72, ISSN 0009-2614, https://doi.org/10.1016/j.cplett.2016.04.030.
(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0009261416302159) - Čiegis, V Starikovičius, N Tumanova, M Ragulskis: Application of distributed parallel computing for dynamic visual cryptography
10.1007/s11227-016-1733-8. The Journal of Supercomputing 72 (2016) 4204-20. - A Kynienė, S Pakalka,Š Masys and V Jonauskas
Journal of Physics B: Atomic, Molecular and Optical Physics
http://iopscience.iop.org/article/10.1088/0953-4075/49/18/185001/meta -
Simona Streckaite, Renata Karpicz, Alytis Gruodis, Wim Dehaen, Sven Van Snick, Mindaugas Kirkus, Saulius Grigalevicius, Juozas V. Grazulevicius, Vidmantas Gulbinas, Fluorescence quenching of indolo[3,2-b]carbazole compounds by conformational motions of attached substituents, In Dyes and Pigments, Volume 133, 2016, Pages 120-126, ISSN 0143-7208, https://doi.org/10.1016/j.dyepig.2016.05.040.
(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0143720816302303)
Keywords: Indolo[3,2-b]carbazole; Conformational motion; Fluorescence quenching; Excited state relaxation - V.Abramavicius, V. Pranculis, A.Melianas, O.Inganäs, V. Gulbinas, D. Abramavicius
Scientific Reports | 6:32914 | DOI: 10.1038/srep32914 - Jevgenij Chmeliov, Andrius Gelzinis, Egidijus Songaila, Ramūnas Augulis, Christopher D. P. Duffy, Alexander V. Ruban, Leonas Valkunas
The nature of self-regulation in photosynthetic light-harvesting antenna
Nature Plants 2016 16045, 1-7
2015 publikacijos
- Daumantas Petkevicius. QUANTUM CHEMICAL MODELLING OF ACIDITY CONSTANTS IN ORGANIC MOLECULES. ORGANINIU MOLEKULIU RUGŠTINGUMO PARAMETRU MODELIAVIMAS KVANTINES CHEMIJOS METODAIS. Bakalauro studiju kursinis darbas (vad. dr. Kestutis Aidas), 2015
- Karolis Kalantojus. KUGINIU X IR O BANGU FORMAVIMO PARAMETRINIAME STIPRINTUVE SKAITMENINIS TYRIMAS. Magistranturos studiju baigiamasis darbas (vad. prof. habil. dr. Gintaras Valiulis), 2015
- Daumantas Petkevicius. ORGANINIU MOLEKULIU RUGŠTINGUMO PARAMETRU MODELIAVIMAS KVANTINES CHEMIJOS METODAIS. Bakalauro studiju baigiamasis darbas (vad. dr. Kestutis Aidas )
2015 - Kastytis Zubovas AGN activity and nuclear starbursts: Sgr A* activity shapes the Central Molecular Zone Mon. Not. R. Astron. Soc. 000, 000–000 (0000) (Submitted on 20 May 2015) arXiv:1505.05464 [astro-ph.GA]
- V. Jonauskas,* A. Kynien˙e, G. Merkelis, G. Gaigalas, R. Kisielius, S. Kučas, Š. Masys, L. Radžiūt]r, and P. Rynkun Contribution of high-nl shells to electron-impact ionization processes PHYSICAL REVIEW A 91, 012715 (2015)
- Mindaugas Macernis, Denise Galzerano, Juozas Sulskus, Elizabeth Kish, Young-Hun Kim, Sangho Koo, Leonas Valkunas, and Bruno Robert Resonance Raman Spectra of Carotenoid Molecules: Influence of Methyl Substitutions The Journal of Physical Chemistry A 2015 119 (1), 56-66 DOI: 10.1021/jp510426m
- Ieva Matulaitienė, Zenonas Kuodis, Algirdas Matijoška, Olegas Eicher-Lorka, and Gediminas Niaura SERS of the Positive Charge Bearing Pyridinium Ring Terminated Self-Assembled Monolayers: Structure and Bonding Spectral Markers The Journal of Physical Chemistry C 2015 119, 26481-26492
2014 publikacijos
- Mindaugas Macernis, Juozas Sulskus, Svetlana Malickaja, Bruno Robert, and Leonas Valkunas Resonance Raman Spectra and Electronic Transitions in Carotenoids: A Density Functional Theory Study The Journal of Physical Chemistry A 2014 118 (10), 1817-1825 DOI: 10.1021/jp406449c
- Stepas Toliautas, Mindaugas Macernis, Juozas Sulskus, Leonas Valkunas Solvent effect on the photo-induced proton transfer in 2-(N-methyl-α-iminoethyl)-phenol Chemical Physics Letters, Volume 591, 20 January 2014, Pages 52–57 DOI: 10.1016/j.cplett.2013.10.084
- A. Kadashchuk, Yu. Skryshevski, A. Vakhnin, S. Toliautas, J. Sulskus, R. Augulis, V. Gulbinas, S. Nespurek, J. Genoe, and L. Valkunas Highly Efficient Intrinsic Phosphorescence from a σ-Conjugated Poly(silylene) Polymer The Journal of Physical Chemistry C 2014 118 (40), 22923-22934 DOI: 10.1021/jp506959m
- Iryna Doroshenko, Vytautas Balevicius, George Pitsevich, Kestutis Aidas, Valdas Sablinskas, Valeriy Pogorelov FTIR/PCA study of propanol in argon matrix: the initial stage of clustering and conformational transitions, Low Temperature Physics/Fizika Nizkikh Temperatur, 2014, v. 40, No. 12, pp. 1384–1390
- V. Jonauskas, A. Prancikevičus,S. Masys, A. Kynienė, Electron-impact direct double ionization as a sequence of processes, PHYSICAL REVIEW A 89, 052714 (2014)
- Kastytis Zubovas, Sergei Nayakshin Energy- and momentum-conserving AGN feedback outflows MNRAS (May 21, 2014) 440 (3): 2625-2635. doi: 10.1093/mnras/stu431
- Kastytis Zubovas, Kostas Sabulis,Rokas Naujalis Collapse and fragmentation of molecular clouds under pressure MNRAS 442, 2837–2854 (2014) doi:10.1093/mnras/stu1048
- Toliautas Stepas. Elektroninio suţadinimo procesai fotoaktyviose organinėse molekulėse. Daktaro disertacija.
- Povilas Milgevičius. Data analysis program of massive quantum chemistry calculations. KVANTINĖS CHEMIJOS DIDELIO KIEKIO SKAIČIAVIMŲ REZULTATŲ APDOROJIMO PROGRAMA. Pagrindinių studijų baigiamasis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2014
- Povilas Milgevičius. Kvantinių skaičiavimų analizės programa, naudojanti kvantinių skaičiavimų duomenų bazę. Kursinis darbas (vad. Mindaugas Mačernis).
2013 publikacijos
- C. D. P. Duffy, J. Chmeliov, M. Macernis, J. Sulskus, L. Valkunas, and A. V. Ruban Modeling of Fluorescence Quenching by Lutein in the Plant Light-Harvesting Complex LHCII The Journal of Physical Chemistry B 2013 117 (38), 10974-10986 DOI: 10.1021/jp3110997
- V. Balevičius, Jr., A. Gelzinis, D. Abramavicius, and L. Valkunas Excitation Energy Transfer and Quenching in a Heterodimer: Applications to the Carotenoid–Phthalocyanine Dyads The Journal of Physical Chemistry B 2013 117 (38), 11031-11041 DOI: 10.1021/jp3118083
- Andrius Gelzinis, Leonas Valkunas, Franklin D Fuller, Jennifer P Ogilvie, Shaul Mukamel, Darius Abramavicius Tight-binding model of the photosystem II reaction center: application to two-dimensional electronic spectroscopy. New Journal of Physics 15 (2013) 075013
- V. Jonauskas, A. Prancikevičius, Š. Masys, A. Kynienė Electron-impact direct double ionization (Submitted on 28 Nov 2013) arXiv:1311.7415 [physics.atom-ph]
- Pavel Brižis. Cu and Sn Complex Modelling Using Quantum Chemistry Methods in Various Polyether Environments. Vario ir alavo molekulinių kompleksų modeliavimas kvantinės chemijos metodais polieterių aplinkoje. Kursinis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2013
- Ruslan Karpovič. The Database and Information System for the results of the Quantum Chemical calculations. Kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų duomenų bazė ir informacinė sistema. Pagrindinių studijų baigiamasis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2013
- Gytis Bašinskas. TEORINIS RESTRIKCIJOS ENDONUKLEAZĖS DNR SEKOS ATPAŽINIMO CENTRO MODELIAVIMAS. Mokslinis tiriamasis darbas III (vad. Mindaugas Mačernis). 2013
- Gytis Bašinskas. Analysis of the DNA sequence recognition of the BcnI restriction endonuclease by quantum chemistry methods, BCNI RESTRIKCIJOS ENDONUKLEAZĖS DNR SEKOS ATPAŽINIMO ANALIZĖ KVANTINĖS CHEMIJOS METODAIS. Magistrantūros studijų baigiamasis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2013
- Ruslan Karpovič. Design and development of the database for Quantum Chemical calculations. Kvantinės chemijos skaičiavimų rezultatų duomenų bazės projektavimas ir kūrimas. Kursinis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2013
2012 publikacijos
- Mindaugas Macernis, Juozas Sulskus, Christopher D. P. Duffy, Alexander V. Ruban, and Leonas Valkunas Electronic Spectra of Structurally Deformed Lutein The Journal of Physical Chemistry A 2012 116 (40), 9843-9853
DOI: 10.1021/jp304363q - Stepas Toliautas, Juozas Sulskus, Leonas Valkunas, Mikas Vengris,Quantum chemical studies of photochromic properties of benzoxazine compound, Chemical Physics, Volume 404, 24 August 2012, Pages 64-73, ISSN 0301-0104, DOI:10.1016/j.chemphys.2012.03.006.
- Julija Litvaitytė. Quantum chemical modeling of molecular complexes of polyethers with copper and tin. POLIETERIŲ MOLEKULINIŲ KOMPLEKSŲ SU VARIU IR ALAVU MODELIAVIMAS KVANTINĖS CHEMIJOS METODAIS. Baigiamasis darbas (vad. Mindaugas Mačernis).
- Julija Litvaitytė. Polieterių elekrocheminės elgsenos ant vario ir alavo elektrodų modeliavimas kvantinės chemijos metodais. Kursinis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2012
- Rimvydas Jasinkas. Structure Analysis of Bacteriorohodopsin Photocycle Initial States. Bakteriorodopsino fotociklo pradinių būsenų struktūrų analizė. Magistro studijų kursinis darbas (vad. Mindaugas Mačernis). 2012
- Gytis Bašinskas. Quantum Chemical Modeling of the DNA Sequence Recognition Mechanism in Restriction Endonuclease. DNR sekos atpažinimo restrikcijos endonukleazėje modeliavimas kvantinės chemijos metodais. Mokslinis tiriamasis darbas I (vad. Mindaugas Mačernis). 2012
- Gytis Bašinskas. The analyzation of DNA sequence cleavage in BcnI restriction endonuclease. DNR SEKOS KIRPIMO MECHANIZMO BCNI RESTRIKCIJOS ENDONUKLEAZĖJE ANALIZĖ. Mokslinis tiriamasis darbas II (vad. Mindaugas Mačernis).
Vartotojams
Rekomenduojamas tekstas straipsnių padėkose
lietuviškai:
Darbe buvo naudotas Vilniaus universiteto Fizikos fakulteto dalies superkompiuteris: „VU HPC“ Saulėtekis.
angliškai:
Computations were performed on resources at the supercomputer "VU HPC" Saulėtekis of Vilnius University in Faculty of Physics.
Atviros prieigos centras
Paraiškos priimamos nuolat (galima teikti pariodo viduryje). Konsultacijos el. paštu: .
Informacija verslui ir viešam sektoriui
Paslaugos
- Konsultavimas ir pagalba panaudojant APC išteklius
- Pagalba naudojant kvantinių kompiuterių simuliatorius, konsultavimas ir programų adaptavimas kvantiniams kompiuteriams, kompiliavimas, testavimas
- MATLAB skaičiavimai (skaičiavimo metodų ir taikomųjų programų naudojimo superkompiuteryje konsultacijos, skaičiavimai, tyrimai)
- Konsultavimas ir pagalba panaudojant APC kompiliatorius, derinant programas, programų kompiliavimas, testavimas (skaičiavimo metodų ir taikomųjų programų naudojimo superkompiuteryje konsultacijos, skaičiavimai, tyrimai)
- Kvantinės chemijos, molekulių dinamikos ir molekulių mechanikos skaičiavimai (skaičiavimo metodų ir taikomųjų programų naudojimo superkompiuteryje konsultacijos, skaičiavimai, tyrimai)
Įranga
Kvietimai
Kvietimai
Kvietimas teikti paraiškas laikotarpiui nuo 2025 sausio 30 d. iki 2024 birželio 30 d.
Ataskaitos priimamos kartu su paraiškomis.
Naudotis „HPC Saulėtekis“ paslaugomis galėsite po paraiškų svarstymo,
o pratęsiantys skaičiavimų laikotarpį gali tęsti skaičiavimus tol kol bus priimtas galutinis sprendimas.
Pastaba 1 : bakalauro ir magistro studijų studentai paraiškas teikia kartu su savo vadovu.
Pastaba 2: mokslininkai, doktorantai vykdydami ne savo projektą, turi pateikti projekto vadovo sutikimą (laisva forma).
Numatomi būsimi kiti skaičiavimo laikotarpiai
- nuo 2025 birželio 30 d. iki 2026 rugsėjo 15 d.
- nuo 2025 rugsėjo 15 d. iki 2026 Sausio 30 d.
Dokumentai
LIETUVOS MOKSLINIŲ TYRIMŲ INFRASTRUKTŪRŲ KELRODIS: LitGrid-HPC (dokumentas 1, dokumentas 2)
Kontaktai
Kontaktai
HPC resursų valdymas, informacija ir konsultacijos
APC valdymo grupės vadovas
Doc. dr. Mindaugas Mačernis
El.paštas:
Tel. +370 5 223 4659
Cheminės fizikos institutas, Fizikos fakultetas
Vilniaus universitetas
Saulėtekio al. 3, LT-10222 Vilnius, Lietuva
Mokymai
- NCC Lietuva Mokymai
- Konsultacijos penktadieniais 14 val.
būtina išankstinė registracija el. p.: