Šakiniai akademiniai padaliniai Branduolių ir elementariųjų dalelių fizikos centras (sui generis padalinys Fizikos fakultete) Cheminės fizikos institutas Fotonikos ir nanotechnologijų institutas Lazerinių tyrimų centras Taikomosios elektrodinamikos ir telekomunikacijų institutas Teorinės fizikos ir astronomijos institutas